More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0353 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0353  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 		 417 aa  848    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.854568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2817  tryptophan synthase subunit beta  54.75 
 
 		 412 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  56.14 
 
 		 409 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5127  tryptophan synthase, beta subunit  50.36 
 
 		 414 aa  408  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  50.63 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  54.47 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2240  tryptophan synthase subunit beta  49.88 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  51.8 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  49.63 
 
 		 412 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  52.97 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  51.84 
 
 		 409 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  52.63 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  50.66 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  52.2 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  50.38 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  50.66 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  54.05 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  52.2 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  51.18 
 
 		 394 aa  395  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  50.38 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  49.87 
 
 		 394 aa  391  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  51.02 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  51.81 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1662  tryptophan synthase subunit beta  48.27 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  50.52 
 
 		 399 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  50.52 
 
 		 399 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  50.51 
 
 		 406 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  51.94 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  51.16 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  51.16 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  48.62 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  51.3 
 
 		 403 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1158  tryptophan synthase subunit beta  53.71 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  50.74 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  51.02 
 
 		 402 aa  388  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4868  tryptophan synthase subunit beta  49.5 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  52.07 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  51.44 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  49.47 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  51.18 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  50.13 
 
 		 409 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  51.44 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  48.45 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  51.05 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  49.87 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  47.77 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  51.18 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  49.36 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  48.09 
 
 		 404 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  51.44 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  51.57 
 
 		 671 aa  386  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  49.62 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  48.83 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  52.65 
 
 		 389 aa  388  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  49.87 
 
 		 403 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  51.18 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  50.26 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  51.31 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  50.52 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  47.95 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  50.66 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  50.52 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  51.58 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1361  tryptophan synthase subunit beta  54.21 
 
 		 391 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.059714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  48.21 
 
 		 396 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  48.72 
 
 		 425 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  49.62 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  50.92 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  50.92 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  50.66 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1306  bifunctional phosphoribosylanthranilate isomerase/tryptophan synthase subunit beta  50.65 
 
 		 600 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209698  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  48.96 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  50.92 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1827  tryptophan synthase subunit beta  50.52 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  48.96 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  49.35 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  50.53 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  47.97 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  49.36 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  51.58 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  49.61 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  49.61 
 
 		 400 aa  378  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1253  bifunctional phosphoribosylanthranilate isomerase/tryptophan synthase subunit beta  50.65 
 
 		 600 aa  381  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.562305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  49.87 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  49.1 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  49.61 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  50.66 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  49.74 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  49.36 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0337  tryptophan synthase subunit beta  48.12 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  51.44 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  50.66 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  49.74 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  48.84 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  48.95 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  48.96 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0055  tryptophan synthase subunit beta  46.77 
 
 		 414 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.660106  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  49.48 
 
 		 404 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  46.94 
 
 		 414 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>