More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5127 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5127  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 		 414 aa  852    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2240  tryptophan synthase subunit beta  70.62 
 
 		 408 aa  608  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0337  tryptophan synthase subunit beta  66.09 
 
 		 414 aa  553  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1662  tryptophan synthase subunit beta  56.37 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 391 aa  450  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  56.19 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  57.22 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  56.25 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  55.84 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  55.95 
 
 		 404 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  56.25 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  56.78 
 
 		 406 aa  441  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  56.38 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  55.38 
 
 		 394 aa  438  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  55.9 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  53.71 
 
 		 406 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  54.43 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  54.43 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  54.45 
 
 		 396 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  53.32 
 
 		 404 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 409 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  55.09 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  54.75 
 
 		 414 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  56.19 
 
 		 410 aa  431  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  54.43 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 396 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  54.64 
 
 		 408 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  53.33 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2817  tryptophan synthase subunit beta  53.79 
 
 		 412 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  55.08 
 
 		 671 aa  431  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  53.81 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  53.18 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  54.52 
 
 		 404 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  54.1 
 
 		 400 aa  430  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0147  tryptophan synthase subunit beta  55.36 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  54.29 
 
 		 409 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  53.81 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  53.91 
 
 		 402 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  51.97 
 
 		 412 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  54.68 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  53.63 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  54.64 
 
 		 405 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  53.08 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  56.09 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  54.68 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  54.68 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  51.96 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  53.81 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  55.15 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  53.05 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  53.81 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  54.48 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  53.98 
 
 		 415 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  53.71 
 
 		 404 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  54.05 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  52.27 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  54.24 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  53.55 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  53.55 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1872  tryptophan synthase subunit beta  53.13 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0911585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  52.3 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  53.81 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  53.55 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  54.68 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  53.91 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  54.68 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  53.55 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  53.55 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  53.51 
 
 		 409 aa  428  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  54.68 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  52.3 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  54.12 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  51.53 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  53.44 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  53.3 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  52.27 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  52.93 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0055  tryptophan synthase subunit beta  53.23 
 
 		 414 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.660106  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  53.65 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  53.33 
 
 		 401 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  52.66 
 
 		 407 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  53.71 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 403 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  52.67 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  52.14 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  54.01 
 
 		 406 aa  421  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  55.67 
 
 		 420 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  53.94 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  52.82 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  55.04 
 
 		 389 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>