More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2240 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2240  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 408 aa  851    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0337  tryptophan synthase subunit beta  71.67 
 
 		 414 aa  619  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5127  tryptophan synthase, beta subunit  70.62 
 
 		 414 aa  608  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1662  tryptophan synthase subunit beta  61.23 
 
 		 418 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  58.72 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 396 aa  464  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  58.66 
 
 		 409 aa  461  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  59.33 
 
 		 404 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 409 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 400 aa  461  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  60.67 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 405 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  58.03 
 
 		 406 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  57.91 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  58.81 
 
 		 402 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  55.94 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 405 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  58.76 
 
 		 405 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 405 aa  458  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  58.66 
 
 		 391 aa  455  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  57.65 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 405 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  58.51 
 
 		 403 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  56.3 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 414 aa  451  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  57.77 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  59.45 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  56.89 
 
 		 406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  58.03 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  57.77 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  55.39 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 401 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 422 aa  448  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 399 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 396 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  58.51 
 
 		 404 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 406 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  56.93 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  56.99 
 
 		 409 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2817  tryptophan synthase subunit beta  54.86 
 
 		 412 aa  450  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  58.06 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  58.03 
 
 		 406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  57.47 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 397 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  58.66 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  57.73 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  57.47 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  57.99 
 
 		 407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  57.73 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  57.99 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  57.73 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  57.73 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  57.22 
 
 		 412 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 420 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  57.22 
 
 		 409 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  57.47 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 409 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  57.73 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 394 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  57.47 
 
 		 404 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 404 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 405 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2454  tryptophan synthase subunit beta  56.25 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  55.16 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  56.82 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  56.82 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 409 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  57.47 
 
 		 397 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  58.12 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  57.47 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 		 399 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>