More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0337 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0337  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 414 aa  855    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2240  tryptophan synthase subunit beta  71.67 
 
 		 408 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5127  tryptophan synthase, beta subunit  66.09 
 
 		 414 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1662  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  59.02 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 409 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  56.6 
 
 		 442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2817  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3023  tryptophan synthase subunit beta  55.7 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  59.02 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1458  tryptophan synthase subunit beta  55.96 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1524  tryptophan synthase subunit beta  55.96 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0500753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1516  tryptophan synthase subunit beta  55.96 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1586  tryptophan synthase subunit beta  55.36 
 
 		 409 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1660  tryptophan synthase subunit beta  54.66 
 
 		 396 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014764 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  55.67 
 
 		 391 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2726  tryptophan synthase subunit beta  54.66 
 
 		 396 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.93556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2407  tryptophan synthase subunit beta  54.92 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1425  tryptophan synthase subunit beta  55.1 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2805  tryptophan synthase subunit beta  54.66 
 
 		 396 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2133  tryptophan synthase subunit beta  55.7 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.31152  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  55.67 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  55.24 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1682  tryptophan synthase subunit beta  54.39 
 
 		 407 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  55.01 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2705  tryptophan synthase subunit beta  54.4 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  55.35 
 
 		 393 aa  435  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  53.09 
 
 		 394 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  54.25 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  54.64 
 
 		 406 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  55.01 
 
 		 406 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  55.84 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2916  tryptophan synthase subunit beta  55.18 
 
 		 407 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10970  tryptophan synthase subunit beta  54.75 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0274745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2255  tryptophan synthase subunit beta  54.66 
 
 		 403 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0836198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  55.38 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  53.61 
 
 		 406 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  55.01 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2454  tryptophan synthase subunit beta  54.92 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  54.87 
 
 		 409 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 420 aa  431  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  54.03 
 
 		 405 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  54.03 
 
 		 405 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  52.32 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 406 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  54.55 
 
 		 409 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  52.9 
 
 		 410 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  53.92 
 
 		 411 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  54.24 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  52.58 
 
 		 394 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  54.24 
 
 		 405 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  54.22 
 
 		 404 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  54.29 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  55.24 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  56.15 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  56.15 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  55.13 
 
 		 420 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  54.03 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  54.81 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  54.03 
 
 		 409 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 404 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 411 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  55.9 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  52.93 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2510  tryptophan synthase subunit beta  55.33 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1936  tryptophan synthase subunit beta  54.26 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  55.9 
 
 		 408 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  54.38 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  55.27 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  56.74 
 
 		 418 aa  426  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  53.61 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  55.27 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  54.99 
 
 		 415 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  54.34 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  53.35 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  54.43 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  53.96 
 
 		 406 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  54.29 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  55.13 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  53.08 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2003  tryptophan synthase subunit beta  53.47 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2302  tryptophan synthase subunit beta  53.47 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2671  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000253614 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  56.04 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  52.06 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  54.36 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  52.56 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  53.59 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  52.56 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  54.75 
 
 		 389 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  53.85 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  53.33 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  54.75 
 
 		 389 aa  424  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>