More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1662 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1662  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 418 aa  869    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2240  tryptophan synthase subunit beta  61.23 
 
 		 408 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0337  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 414 aa  506  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5127  tryptophan synthase, beta subunit  56.37 
 
 		 414 aa  500  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 396 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  55.56 
 
 		 406 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  56.04 
 
 		 406 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 399 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 399 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  56.33 
 
 		 406 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  54.9 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  55.38 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  54.17 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  54.78 
 
 		 422 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  55.04 
 
 		 406 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 		 406 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  55.56 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  55.75 
 
 		 402 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  55.36 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  53.87 
 
 		 391 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  55.36 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  53.85 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  54.78 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  53.85 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  53.85 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  53.08 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  55.04 
 
 		 401 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  53.85 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  54.92 
 
 		 403 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  53.51 
 
 		 408 aa  430  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  56.04 
 
 		 409 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  53.33 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  53.85 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  56.51 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  53.59 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  53.85 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  52.99 
 
 		 402 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  54.4 
 
 		 403 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  53.08 
 
 		 397 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  54.36 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  54.05 
 
 		 394 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 401 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  53.33 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  53.96 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  53.91 
 
 		 409 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  53.08 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  53.08 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  53.87 
 
 		 398 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  53.08 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  54.03 
 
 		 412 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  53.63 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  53.85 
 
 		 404 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  55.3 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  52.94 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  54.73 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  53.52 
 
 		 394 aa  421  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  54.34 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  53.71 
 
 		 409 aa  423  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  53.08 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  53.23 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  53.33 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  53.3 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  53.32 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  52.82 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  54.01 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  53.26 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2255  tryptophan synthase subunit beta  52.15 
 
 		 403 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0836198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  53.51 
 
 		 409 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  54.01 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  54.87 
 
 		 409 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  54.87 
 
 		 409 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  52.45 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1586  tryptophan synthase subunit beta  53.21 
 
 		 409 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  54.78 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0728  tryptophan synthase subunit beta  52.47 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  53.71 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  53.21 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  52.94 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  53.59 
 
 		 404 aa  421  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  54.22 
 
 		 419 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  54.22 
 
 		 410 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  53.23 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  53.08 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  53.63 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  53.63 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  53.37 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  53.2 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  50.76 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>