More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2817 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2817  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 412 aa  847    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 		 409 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 409 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  62.86 
 
 		 406 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 		 396 aa  481  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 		 406 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  61.82 
 
 		 410 aa  482  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  60.31 
 
 		 402 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  59.1 
 
 		 405 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  61.14 
 
 		 396 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 		 401 aa  478  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  60.82 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  58.99 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  61.11 
 
 		 422 aa  478  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  58.93 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  61.72 
 
 		 396 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  58.47 
 
 		 394 aa  475  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 399 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  60.84 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 399 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 404 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  58.44 
 
 		 408 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  61.74 
 
 		 401 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 404 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  59.48 
 
 		 404 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 403 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  59.68 
 
 		 409 aa  471  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 404 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  57.94 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  59.26 
 
 		 411 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  58.64 
 
 		 411 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  58.51 
 
 		 410 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  60.69 
 
 		 406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  57.67 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  58.62 
 
 		 394 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  58.47 
 
 		 406 aa  465  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 409 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  58.64 
 
 		 397 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 410 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  59.89 
 
 		 406 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 409 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  59.22 
 
 		 404 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  57.94 
 
 		 405 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  57.94 
 
 		 406 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  59.1 
 
 		 406 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  58.2 
 
 		 405 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 403 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 398 aa  458  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  56.66 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.2 
 
 		 405 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.2 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  58.36 
 
 		 394 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  56.61 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  56.28 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 403 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1158  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 419 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 391 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 410 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  57.41 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  57.92 
 
 		 404 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  58.47 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  56.22 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 407 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  56.08 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  57.85 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>