More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1253 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1306  bifunctional phosphoribosylanthranilate isomerase/tryptophan synthase subunit beta  99.17 
 
 		 600 aa  1228    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209698  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1253  bifunctional phosphoribosylanthranilate isomerase/tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 600 aa  1238    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.562305  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  55.4 
 
 		 442 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.89 
 
 		 409 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  59.37 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 414 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  56.11 
 
 		 443 aa  472  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  58.84 
 
 		 403 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3526  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  58.47 
 
 		 418 aa  463  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  58.05 
 
 		 399 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  58.05 
 
 		 399 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  59.37 
 
 		 394 aa  463  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  58.03 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 404 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1158  tryptophan synthase subunit beta  58.56 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  58.38 
 
 		 425 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1936  tryptophan synthase subunit beta  58.89 
 
 		 396 aa  465  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  59.37 
 
 		 404 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2207  tryptophan synthase subunit beta  58.62 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.823385  normal  0.0123051 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  58.03 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  56.3 
 
 		 418 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 406 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  59.42 
 
 		 389 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  57.78 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  60.69 
 
 		 396 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  59.42 
 
 		 389 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  56.88 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  58.36 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  56.77 
 
 		 397 aa  458  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 405 aa  458  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  56.78 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10970  tryptophan synthase subunit beta  55.93 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0274745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  55.56 
 
 		 414 aa  458  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 412 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  58.16 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  59.63 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2176  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  57.4 
 
 		 420 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  56.77 
 
 		 397 aa  458  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  56.09 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  59.47 
 
 		 400 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  57.77 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  56.22 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  56.06 
 
 		 419 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  56.88 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  56.88 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  58.95 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  56.25 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  56.74 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  56.57 
 
 		 410 aa  458  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2133  tryptophan synthase subunit beta  58.09 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.31152  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  56.88 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  56.78 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  56.1 
 
 		 405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01235  tryptophan synthase subunit beta  58.36 
 
 		 397 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2387  tryptophan synthase, beta subunit  58.36 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.532965  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  56.48 
 
 		 403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 397 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  58.49 
 
 		 393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  56.09 
 
 		 410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  59.37 
 
 		 395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2003  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 397 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 397 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  56.22 
 
 		 399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  56.2 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2366  tryptophan synthase subunit beta  58.36 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  55.81 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 397 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2916  tryptophan synthase subunit beta  57.78 
 
 		 407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 		 420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 398 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1486  tryptophan synthase subunit beta  58.36 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01245  hypothetical protein  58.36 
 
 		 397 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  56.12 
 
 		 447 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  57.26 
 
 		 405 aa  455  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  56.04 
 
 		 403 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  56.77 
 
 		 403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1871  tryptophan synthase subunit beta  58.36 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000282354 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1460  tryptophan synthase subunit beta  58.36 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00292681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1370  tryptophan synthase subunit beta  58.36 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  56.2 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  57.92 
 
 		 406 aa  455  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 397 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  55.67 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 397 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  56.01 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>