More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1827 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1827  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 408 aa  846    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4896  tryptophan synthase subunit beta  77.46 
 
 		 393 aa  646    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5479  tryptophan synthase, beta subunit  74.17 
 
 		 399 aa  635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3795  tryptophan synthase subunit beta  74.94 
 
 		 399 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3024  tryptophan synthase subunit beta  73.64 
 
 		 393 aa  622  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.418532  normal  0.0482136 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06380  tryptophan synthase beta chain  73.66 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.211017  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3296  tryptophan synthase subunit beta  72.02 
 
 		 398 aa  604  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  61.88 
 
 		 389 aa  490  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  61.88 
 
 		 389 aa  490  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  57.82 
 
 		 409 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  58.82 
 
 		 418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0147  tryptophan synthase subunit beta  56.69 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  58.16 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.16 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 409 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 406 aa  464  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.16 
 
 		 405 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 401 aa  461  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  56.97 
 
 		 408 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  59.42 
 
 		 404 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 393 aa  464  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 402 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  59.47 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  57.81 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 399 aa  458  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  55.91 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  55.91 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 403 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 410 aa  458  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 409 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  56.33 
 
 		 402 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  55.67 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  56.09 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 403 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1990  tryptophan synthase subunit beta  58.38 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  57.03 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0055  tryptophan synthase subunit beta  56.89 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.660106  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  56.35 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0491  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 397 aa  454  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  56.72 
 
 		 404 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  56.97 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 		 413 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  59.42 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  59.18 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  57.81 
 
 		 405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  56.77 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 410 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1297  tryptophan synthase subunit beta  57.91 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.311384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  55.33 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  58.16 
 
 		 410 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 400 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  56.38 
 
 		 414 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  57.91 
 
 		 419 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  56.57 
 
 		 413 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  57.81 
 
 		 397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  57.29 
 
 		 402 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0118  tryptophan synthase subunit beta  56.5 
 
 		 413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0176  tryptophan synthase subunit beta  56.25 
 
 		 430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  55.11 
 
 		 411 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  58.64 
 
 		 405 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  57.44 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  57.85 
 
 		 407 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  56.77 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  56.51 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  56.46 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>