More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06380 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4896  tryptophan synthase subunit beta  79.74 
 
 		 393 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541071  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06380  tryptophan synthase beta chain  100 
 
 		 397 aa  822    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.211017  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1827  tryptophan synthase subunit beta  73.66 
 
 		 408 aa  619  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5479  tryptophan synthase, beta subunit  72.05 
 
 		 399 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3024  tryptophan synthase subunit beta  72.56 
 
 		 393 aa  616  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.418532  normal  0.0482136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3296  tryptophan synthase subunit beta  71.32 
 
 		 398 aa  600  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3795  tryptophan synthase subunit beta  71.1 
 
 		 399 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  60.52 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0491  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 399 aa  471  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  58.67 
 
 		 413 aa  471  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  59.13 
 
 		 402 aa  472  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  58.6 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  57.32 
 
 		 413 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  57.32 
 
 		 413 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  57.18 
 
 		 409 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 399 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  55.93 
 
 		 411 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 401 aa  464  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  58.02 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  57.72 
 
 		 409 aa  463  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  57.96 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  59.43 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  60.37 
 
 		 409 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 404 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  56.61 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  56.15 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0535  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 399 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000244592  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1297  tryptophan synthase subunit beta  59.28 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.311384  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 404 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  56.88 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  58.93 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 402 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  56.62 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  56.15 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  56.63 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  58.66 
 
 		 404 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  56.63 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  57.69 
 
 		 402 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 402 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0776  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 400 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  58.03 
 
 		 395 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0176  tryptophan synthase subunit beta  55.67 
 
 		 430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  55.2 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0055  tryptophan synthase subunit beta  55.61 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.660106  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 407 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  55.9 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0147  tryptophan synthase subunit beta  55.25 
 
 		 417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  58.49 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  55.22 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  55.1 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 405 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1990  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  56.02 
 
 		 410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0118  tryptophan synthase subunit beta  55.92 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  54.71 
 
 		 434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  58.01 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  56.56 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0201  tryptophan synthase subunit beta  55.67 
 
 		 413 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 410 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  57.92 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  56.89 
 
 		 409 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  55.78 
 
 		 411 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 409 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  55.58 
 
 		 418 aa  448  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>