More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4896 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4896  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 393 aa  814    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1827  tryptophan synthase subunit beta  77.46 
 
 		 408 aa  646    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06380  tryptophan synthase beta chain  79.74 
 
 		 397 aa  659    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.211017  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3024  tryptophan synthase subunit beta  73.79 
 
 		 393 aa  628  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.418532  normal  0.0482136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5479  tryptophan synthase, beta subunit  71.54 
 
 		 399 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3795  tryptophan synthase subunit beta  71.03 
 
 		 399 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3296  tryptophan synthase subunit beta  69.59 
 
 		 398 aa  587  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  58.49 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0491  tryptophan synthase subunit beta  58.16 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  56.49 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  56.63 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  58.9 
 
 		 408 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  56.3 
 
 		 402 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  55.1 
 
 		 413 aa  448  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1297  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 399 aa  450  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.311384  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  59.16 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 420 aa  450  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  58.38 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  56.36 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  55.19 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  55.78 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 404 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0147  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 		 417 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  56.88 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  56.05 
 
 		 411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  56.22 
 
 		 409 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  53.96 
 
 		 411 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  56.3 
 
 		 417 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 394 aa  441  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0535  tryptophan synthase subunit beta  56.12 
 
 		 399 aa  441  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000244592  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  58.42 
 
 		 405 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1024  tryptophan synthase subunit beta  57.85 
 
 		 414 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204551  hitchhiker  0.00011605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  56.22 
 
 		 409 aa  442  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 404 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 		 417 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  56.12 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  55.9 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  55.76 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2176  tryptophan synthase subunit beta  55.44 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  56.3 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 404 aa  438  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  56.04 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1990  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663503 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 394 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  57.96 
 
 		 409 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 402 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  56.02 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2726  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.93556  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  55.01 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  55.01 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  53.98 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2705  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2805  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0055  tryptophan synthase subunit beta  54.25 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.660106  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  55.76 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  55.38 
 
 		 410 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 409 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  55.75 
 
 		 397 aa  434  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  56.54 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  56.36 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1660  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014764 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 409 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  54.25 
 
 		 414 aa  435  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  56.01 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  55.53 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 411 aa  434  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  56.15 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  57.92 
 
 		 410 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1936  tryptophan synthase subunit beta  54.92 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2407  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  54.24 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  55.01 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>