More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3558 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3558  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 354 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2811  regulatory protein LacI  43.5 
 
 		 412 aa  278  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4614  transcriptional regulator, LacI family  45.6 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5308  transcriptional regulator, LacI family  44.85 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0787  LacI family transcription regulator  47.96 
 
 		 375 aa  272  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3640  regulatory protein LacI  43.81 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7379  transcriptional regulator LacI family  42.06 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144359  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0239  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  42.01 
 
 		 351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0263  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  41.42 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3700  LacI family transcription regulator  45.09 
 
 		 337 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3435  regulatory protein, LacI  45.09 
 
 		 354 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3916  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4207  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 		 347 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3596  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2023  LacI family transcription regulator  26.46 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2909  sucrose operon repressor  26.69 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00007545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.71 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0347  transcriptional regulator, LacI family  27.02 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.427458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0391  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.133972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02609  hypothetical protein  27.76 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0874  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  30.22 
 
 		 355 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.52 
 
 		 331 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.52 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3759  transcriptional regulator, LacI family  25.91 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.899629  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000221  fructose repressor FruR LacI family  25.89 
 
 		 326 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  29.39 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.52 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0058  LacI family transcription regulator  29.7 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4401  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.48 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  36.81 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  27.84 
 
 		 344 aa  97.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  29.64 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.26 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.94 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05957  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.58 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  28.21 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0452  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.07 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.91 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  24.12 
 
 		 332 aa  93.2  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3550  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.38 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  26.61 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02648  L-fuculose phosphate aldolase  27.42 
 
 		 314 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  31.16 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2649  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.25 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  30.27 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0609  alanine racemase  29.38 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  28.84 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0089  DNA-binding transcriptional regulator FruR  25.24 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1785  LacI family transcription regulator  29.34 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  29.89 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0432  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.34 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  31.67 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  27.78 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1875  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.5 
 
 		 331 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398277  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  30.19 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  26.9 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 347 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  29.72 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  28.13 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7472  transcriptional regulator LacI family  29.11 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1929  LacI family transcription regulator  24.07 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  27.66 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  27.47 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2029  HTH-type transcriptional repressor  33.52 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.169196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  27.7 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3595  LacI family transcription regulator  29.75 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  28.83 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  26.46 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.24 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4772  LacI family transcription regulator  29.75 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0134  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.18 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.99 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0135  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.18 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  26.29 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0127  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.18 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  26.29 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  36.26 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.18 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.18 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000945493 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  27.99 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00081  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.18 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0088  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.18 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0086  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.18 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0085  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.18 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00080  hypothetical protein  26.18 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3577  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.18 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0073  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.18 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0082  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.18 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3529  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.44 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  27.01 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3399  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.44 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2929  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.44 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4679  LacI family transcription regulator  31.69 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3520  transcriptional regulator, LacI family  26.18 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>