More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0089 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0089  DNA-binding transcriptional regulator FruR  100 
 
 
325 aa  665    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000221  fructose repressor FruR LacI family  74.15 
 
 
326 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05957  DNA-binding transcriptional regulator FruR  72.92 
 
 
331 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0452  DNA-binding transcriptional regulator FruR  73.54 
 
 
326 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3550  DNA-binding transcriptional regulator FruR  55.66 
 
 
327 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0820  DNA-binding transcriptional regulator FruR  48.32 
 
 
331 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2649  DNA-binding transcriptional regulator FruR  48.61 
 
 
337 aa  309  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.4 
 
 
331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0953  fructose repressor FruR, putative  47.09 
 
 
331 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.13 
 
 
329 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.83 
 
 
329 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.57 
 
 
331 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.48 
 
 
331 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.88 
 
 
354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.79 
 
 
330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4401  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.71 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0598  DNA-binding transcriptional regulator FruR  41.77 
 
 
334 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12180  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.82 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0750  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.07 
 
 
334 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3791  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.99 
 
 
334 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3529  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.07 
 
 
336 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3399  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.07 
 
 
336 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00081  DNA-binding transcriptional dual regulator  41.16 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3520  transcriptional regulator, LacI family  41.16 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0086  DNA-binding transcriptional regulator FruR  41.16 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2929  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.07 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0073  DNA-binding transcriptional regulator FruR  41.16 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0082  DNA-binding transcriptional regulator FruR  41.16 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00080  hypothetical protein  41.16 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3577  DNA-binding transcriptional regulator FruR  41.16 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0088  DNA-binding transcriptional regulator FruR  41.16 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.936017 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0636  DNA-binding transcriptional regulator FruR  41.46 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0085  DNA-binding transcriptional regulator FruR  41.16 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0626  DNA-binding transcriptional regulator FruR  41.16 
 
 
334 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.800956  normal  0.256043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3603  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.99 
 
 
334 aa  265  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0127  DNA-binding transcriptional regulator FruR  40.85 
 
 
334 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  40.85 
 
 
334 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15013  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  40.85 
 
 
334 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000945493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0134  DNA-binding transcriptional regulator FruR  40.85 
 
 
334 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0135  DNA-binding transcriptional regulator FruR  40.85 
 
 
334 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0391  transcriptional regulator, LacI family  31.7 
 
 
339 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.133972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0347  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.427458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3596  transcriptional regulator, LacI family  31.68 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4207  LacI family transcription regulator  31.02 
 
 
347 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2023  LacI family transcription regulator  32.11 
 
 
338 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3916  transcriptional regulator, LacI family  31.9 
 
 
334 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3759  transcriptional regulator, LacI family  30.49 
 
 
339 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.899629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2909  sucrose operon repressor  29.97 
 
 
335 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00007545  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02609  hypothetical protein  28.74 
 
 
332 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02648  L-fuculose phosphate aldolase  28.16 
 
 
314 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
346 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3944  transcriptional regulator, LacI family  25.48 
 
 
346 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 
349 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0874  transcriptional regulator, LacI family  27.71 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  27.96 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  28.31 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  28.27 
 
 
340 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  27.66 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  25.89 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.05 
 
 
336 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  27.1 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1892  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 
345 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  23.87 
 
 
348 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  28.34 
 
 
349 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1896  sugar-binding transcriptional regulator RegR  29.38 
 
 
333 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.150149  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4466  LacI family transcription regulator  25.4 
 
 
333 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  32.06 
 
 
330 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  30.4 
 
 
333 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  27.84 
 
 
334 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6362  transcriptional regulator, LacI family  28.5 
 
 
349 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  30 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4042  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.89 
 
 
338 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.21 
 
 
335 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 
342 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  26.67 
 
 
329 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  26.67 
 
 
329 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  29.38 
 
 
344 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3761  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.85 
 
 
338 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1464  transcriptional regulator, LacI family  24.33 
 
 
340 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  26.58 
 
 
338 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  27.72 
 
 
340 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  27.73 
 
 
331 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  26.83 
 
 
334 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2710  regulatory protein, LacI  27.83 
 
 
336 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  27.25 
 
 
347 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  30.81 
 
 
339 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  30.91 
 
 
338 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3162  transcriptional regulator, LacI family  27.49 
 
 
342 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  27.42 
 
 
329 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  30.58 
 
 
344 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3654  LacI family transcription regulator  27.02 
 
 
354 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  27.88 
 
 
325 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.46 
 
 
346 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  28.46 
 
 
346 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 
338 aa  99.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  26.11 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  23.91 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  28.91 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.944766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>