More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0263 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0263  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 351 aa  724    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0239  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  99.15 
 
 		 351 aa  719    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3640  regulatory protein LacI  68.41 
 
 		 355 aa  504  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5308  transcriptional regulator, LacI family  65.04 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4614  transcriptional regulator, LacI family  64.18 
 
 		 352 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2811  regulatory protein LacI  42.48 
 
 		 412 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0787  LacI family transcription regulator  42.68 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3558  LacI family transcription regulator  41.42 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3700  LacI family transcription regulator  44.09 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3435  regulatory protein, LacI  44.09 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7379  transcriptional regulator LacI family  39.01 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4207  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2023  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2909  sucrose operon repressor  27.27 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00007545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3596  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0391  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.133972  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3916  transcriptional regulator, LacI family  27.78 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0347  transcriptional regulator, LacI family  26.15 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.427458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.62 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.14 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.02 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.15 
 
 		 331 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3759  transcriptional regulator, LacI family  27.04 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.899629  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.15 
 
 		 354 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.82 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0874  transcriptional regulator, LacI family  28.26 
 
 		 339 aa  96.3  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12180  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.61 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382176  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000221  fructose repressor FruR LacI family  24.4 
 
 		 326 aa  93.2  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0820  DNA-binding transcriptional regulator FruR  25.98 
 
 		 331 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05957  DNA-binding transcriptional regulator FruR  25.32 
 
 		 331 aa  92.8  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4401  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.49 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0089  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.04 
 
 		 325 aa  91.3  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02609  hypothetical protein  28.52 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0953  fructose repressor FruR, putative  24.7 
 
 		 331 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  24.43 
 
 		 338 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02648  L-fuculose phosphate aldolase  28.19 
 
 		 314 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0598  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.67 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0636  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.63 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.68 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  25.76 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1286  LacI family transcription regulator  27.04 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000013505  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  26.06 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0750  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.68 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3603  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.05 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  26.99 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  26.42 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  28.4 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  28.99 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  26 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  22.43 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3529  DNA-binding transcriptional regulator FruR  21.88 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3791  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.12 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3399  DNA-binding transcriptional regulator FruR  21.88 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0452  DNA-binding transcriptional regulator FruR  25 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00081  DNA-binding transcriptional dual regulator  23.08 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  24.76 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3520  transcriptional regulator, LacI family  23.08 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0085  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.08 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00080  hypothetical protein  23.08 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  25.85 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0086  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.08 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0073  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.08 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3577  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.08 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0088  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.08 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936017 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0082  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.08 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2929  DNA-binding transcriptional regulator FruR  21.88 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0127  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.08 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0135  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.08 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.08 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0626  DNA-binding transcriptional regulator FruR  22.49 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.800956  normal  0.256043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.08 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000945493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0134  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.08 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0256  regulatory protein, LacI  24.84 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0262  regulatory protein LacI  24.84 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  26.2 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  21.5 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  25.82 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.64 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  26.63 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  27.09 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1220  transcriptional regulator, LacI family  23.46 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.485348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  27.46 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.5 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  25.36 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3376  transcriptional regulator, LacI family  23.51 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  25.45 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0146  LacI family transcription regulator  27.49 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  29.34 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  28.04 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  26.55 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.04 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  22.16 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.04 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3162  transcriptional regulator, LacI family  25.84 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  24.31 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.04 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.04 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  28.04 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  24.85 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  27.27 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>