More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0598 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0636  DNA-binding transcriptional regulator FruR  96.11 
 
 
334 aa  662    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0598  DNA-binding transcriptional regulator FruR  100 
 
 
334 aa  687    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3603  DNA-binding transcriptional regulator FruR  90.99 
 
 
334 aa  627  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00081  DNA-binding transcriptional dual regulator  88.89 
 
 
334 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3520  transcriptional regulator, LacI family  88.59 
 
 
334 aa  620  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0085  DNA-binding transcriptional regulator FruR  88.89 
 
 
334 aa  622  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3577  DNA-binding transcriptional regulator FruR  88.89 
 
 
334 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0086  DNA-binding transcriptional regulator FruR  88.89 
 
 
334 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3791  DNA-binding transcriptional regulator FruR  90.39 
 
 
334 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3529  DNA-binding transcriptional regulator FruR  90.36 
 
 
336 aa  621  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0082  DNA-binding transcriptional regulator FruR  88.89 
 
 
334 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0088  DNA-binding transcriptional regulator FruR  88.89 
 
 
334 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.936017 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0134  DNA-binding transcriptional regulator FruR  89.19 
 
 
334 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0135  DNA-binding transcriptional regulator FruR  89.19 
 
 
334 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  89.19 
 
 
334 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15013  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  89.19 
 
 
334 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000945493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0127  DNA-binding transcriptional regulator FruR  89.19 
 
 
334 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0073  DNA-binding transcriptional regulator FruR  88.89 
 
 
334 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00080  hypothetical protein  88.89 
 
 
334 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3399  DNA-binding transcriptional regulator FruR  90.36 
 
 
336 aa  621  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2929  DNA-binding transcriptional regulator FruR  90.36 
 
 
336 aa  620  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0626  DNA-binding transcriptional regulator FruR  88.59 
 
 
334 aa  617  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.800956  normal  0.256043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0750  DNA-binding transcriptional regulator FruR  89.82 
 
 
334 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000221  fructose repressor FruR LacI family  45.12 
 
 
326 aa  295  7e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05957  DNA-binding transcriptional regulator FruR  43.9 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0089  DNA-binding transcriptional regulator FruR  41.77 
 
 
325 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0452  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.6 
 
 
326 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.11 
 
 
331 aa  269  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.68 
 
 
329 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3550  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.51 
 
 
327 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.38 
 
 
329 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  43.29 
 
 
330 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.81 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  48.3 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2649  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.1 
 
 
337 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.5 
 
 
354 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0953  fructose repressor FruR, putative  42.86 
 
 
331 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4401  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.2 
 
 
331 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0820  DNA-binding transcriptional regulator FruR  41.95 
 
 
331 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12180  DNA-binding transcriptional regulator FruR  43.33 
 
 
330 aa  242  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382176  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3596  transcriptional regulator, LacI family  32.2 
 
 
339 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4207  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 
347 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0391  transcriptional regulator, LacI family  32.11 
 
 
339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.133972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0347  transcriptional regulator, LacI family  32 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.427458  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2023  LacI family transcription regulator  29.22 
 
 
338 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3759  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 
339 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.899629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2909  sucrose operon repressor  30.63 
 
 
335 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00007545  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3916  transcriptional regulator, LacI family  28.34 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  28.08 
 
 
336 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02609  hypothetical protein  26.87 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.28 
 
 
336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  27.62 
 
 
332 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656687 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02648  L-fuculose phosphate aldolase  26.73 
 
 
314 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  27.13 
 
 
345 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  27.62 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  29.25 
 
 
340 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  28.93 
 
 
340 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0343  LacI family transcription regulator  26.62 
 
 
338 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0241073  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0874  transcriptional regulator, LacI family  30.67 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 
340 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 
340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  24.68 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  25.87 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  29.04 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  27.53 
 
 
391 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1359  LacI family transcription regulator  28.25 
 
 
350 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.343694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3944  transcriptional regulator, LacI family  25.78 
 
 
346 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  26.21 
 
 
334 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 
349 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4466  LacI family transcription regulator  27.88 
 
 
333 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3632  transcriptional regulator, LacI family  24.61 
 
 
340 aa  112  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1892  transcriptional regulator, LacI family  26.23 
 
 
345 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  25.78 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  25.78 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  26.27 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.05 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  26.69 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  25.78 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  25.78 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  25.78 
 
 
332 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  25.57 
 
 
336 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  25.24 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.42 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  26.69 
 
 
334 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  26.25 
 
 
330 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  26.25 
 
 
330 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  25.79 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  23.96 
 
 
334 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  26.02 
 
 
344 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  26.25 
 
 
330 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  26.37 
 
 
333 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  25.71 
 
 
336 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  26.37 
 
 
333 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  28.25 
 
 
349 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  26.37 
 
 
333 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  23.15 
 
 
335 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  27.44 
 
 
334 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  25.95 
 
 
342 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  26.37 
 
 
333 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>