More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5308 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5308  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 352 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4614  transcriptional regulator, LacI family  92.9 
 
 		 352 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3640  regulatory protein LacI  73.43 
 
 		 355 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0239  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  65.62 
 
 		 351 aa  481  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0263  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  65.04 
 
 		 351 aa  478  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2811  regulatory protein LacI  47.51 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3558  LacI family transcription regulator  44.85 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0787  LacI family transcription regulator  43.41 
 
 		 375 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7379  transcriptional regulator LacI family  42.27 
 
 		 347 aa  265  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144359  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3435  regulatory protein, LacI  42.19 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3700  LacI family transcription regulator  42.19 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4207  LacI family transcription regulator  27.9 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2023  LacI family transcription regulator  26.35 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3916  transcriptional regulator, LacI family  26.77 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0391  transcriptional regulator, LacI family  25.24 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.133972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0347  transcriptional regulator, LacI family  25.55 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.427458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  29.67 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.48 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  29.67 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3759  transcriptional regulator, LacI family  26.44 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.899629  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.36 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.67 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4401  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.81 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2909  sucrose operon repressor  25.71 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00007545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.9 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3596  transcriptional regulator, LacI family  25.44 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0089  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.94 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0874  transcriptional regulator, LacI family  28.75 
 
 		 339 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.3 
 
 		 330 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  27.84 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12180  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0953  fructose repressor FruR, putative  24.12 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  27.88 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00081  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.61 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3520  transcriptional regulator, LacI family  24.61 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0086  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.61 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0073  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.61 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0820  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.12 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3577  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.61 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0088  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.61 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936017 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0082  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.61 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0085  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.61 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00080  hypothetical protein  24.61 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000221  fructose repressor FruR LacI family  26.56 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0135  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.61 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.61 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000945493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0127  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.61 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0134  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.61 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.61 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0598  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.92 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02609  hypothetical protein  25.88 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  27.2 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0626  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.3 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.800956  normal  0.256043 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0636  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.3 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.23 
 
 		 347 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  27 
 
 		 332 aa  85.9  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02648  L-fuculose phosphate aldolase  25.49 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3399  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.95 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  25.45 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3529  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.95 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2929  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.95 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  27.78 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3791  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.06 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3603  DNA-binding transcriptional regulator FruR  23.68 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0750  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.14 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05957  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.76 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  25.97 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  25.15 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  24.93 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  23.57 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  24.93 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  26.18 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2557  LacI family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000811694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  25.22 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.62 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  25.62 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  23.82 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1853  LacI family transcription regulator  27.08 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0619869  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  23.82 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  25.28 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  23.82 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0452  DNA-binding transcriptional regulator FruR  25.89 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  28 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3550  DNA-binding transcriptional regulator FruR  25.81 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  26.17 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  28.65 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  26.17 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1104  periplasmic sugar binding transcriptional regulator  24.85 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  25.59 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  26.17 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2649  DNA-binding transcriptional regulator FruR  25.75 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3162  transcriptional regulator, LacI family  24.07 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  27.01 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1286  LacI family transcription regulator  27.83 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000013505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  26.3 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3376  transcriptional regulator, LacI family  23.33 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>