More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3550 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3550  DNA-binding transcriptional regulator FruR  100 
 
 		 327 aa  664    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000221  fructose repressor FruR LacI family  58.72 
 
 		 326 aa  394  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05957  DNA-binding transcriptional regulator FruR  58.1 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0089  DNA-binding transcriptional regulator FruR  55.66 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0452  DNA-binding transcriptional regulator FruR  56.88 
 
 		 326 aa  362  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  48.94 
 
 		 331 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0953  fructose repressor FruR, putative  47.72 
 
 		 331 aa  291  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0820  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.81 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2649  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.11 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  48.02 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  51.36 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.27 
 
 		 329 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.72 
 
 		 354 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.09 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4401  DNA-binding transcriptional regulator FruR  50.34 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.74 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3529  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.55 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3399  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.55 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0598  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.57 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12180  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.73 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382176  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2929  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.55 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00081  DNA-binding transcriptional dual regulator  44.24 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0073  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3577  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0085  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0082  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0088  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0086  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00080  hypothetical protein  44.24 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3791  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.45 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0626  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.800956  normal  0.256043 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3520  transcriptional regulator, LacI family  44.24 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0636  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.57 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0750  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.55 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0127  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0135  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000945493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0134  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3603  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.15 
 
 		 334 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0347  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.427458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0391  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.133972  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3596  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4207  LacI family transcription regulator  30.16 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3759  transcriptional regulator, LacI family  29.55 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.899629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2023  LacI family transcription regulator  30.23 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2909  sucrose operon repressor  28.31 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00007545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  37.68 
 
 		 346 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3916  transcriptional regulator, LacI family  28.75 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02609  hypothetical protein  31.21 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  33.21 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02648  L-fuculose phosphate aldolase  31.11 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4466  LacI family transcription regulator  28.71 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  28.39 
 
 		 343 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  27.36 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  28.2 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  28.38 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  27.87 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 344 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.25 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3632  transcriptional regulator, LacI family  25.08 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2710  regulatory protein, LacI  26.56 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1892  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  25.16 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6824  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.77 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  27.12 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  27.52 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3654  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  27.86 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  28.95 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  26.57 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.65 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  26.35 
 
 		 338 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  31.58 
 
 		 338 aa  109  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  26.97 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3944  transcriptional regulator, LacI family  29.85 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0874  transcriptional regulator, LacI family  27.58 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2945  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.05 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.884709 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  28.88 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  27.96 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  29.08 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  27.96 
 
 		 340 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  26.82 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 		 346 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  28.76 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  28.71 
 
 		 340 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 336 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.37 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  30.83 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  28.79 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  28.79 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  27.78 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3542  transcriptional regulator, LacI family  24.18 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  25.89 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3162  transcriptional regulator, LacI family  28.38 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>