More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0452 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0452  DNA-binding transcriptional regulator FruR  100 
 
 		 326 aa  666    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000221  fructose repressor FruR LacI family  77.54 
 
 		 326 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05957  DNA-binding transcriptional regulator FruR  78.15 
 
 		 331 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0089  DNA-binding transcriptional regulator FruR  73.54 
 
 		 325 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3550  DNA-binding transcriptional regulator FruR  56.88 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2649  DNA-binding transcriptional regulator FruR  51.53 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0953  fructose repressor FruR, putative  49.54 
 
 		 331 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0820  DNA-binding transcriptional regulator FruR  49.54 
 
 		 331 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  49.54 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  48.01 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.87 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  47.11 
 
 		 329 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12180  DNA-binding transcriptional regulator FruR  48.77 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0750  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.15 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0626  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.82 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.800956  normal  0.256043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3791  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.73 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00081  DNA-binding transcriptional dual regulator  44.51 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0073  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.51 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0085  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.51 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3577  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.51 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0088  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.51 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936017 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00080  hypothetical protein  44.51 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0082  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.51 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0086  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.51 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3520  transcriptional regulator, LacI family  44.21 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0598  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.12 
 
 		 334 aa  276  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0636  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.12 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0135  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.21 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.21 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.21 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000945493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0134  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.21 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0127  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.21 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.48 
 
 		 331 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3399  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.54 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3529  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.54 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2929  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.54 
 
 		 336 aa  275  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.48 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3603  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.82 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.87 
 
 		 354 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4401  DNA-binding transcriptional regulator FruR  48.93 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0391  transcriptional regulator, LacI family  32.03 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.133972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0347  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.427458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3596  transcriptional regulator, LacI family  31.48 
 
 		 339 aa  175  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3759  transcriptional regulator, LacI family  31.05 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.899629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2023  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4207  LacI family transcription regulator  30.72 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2909  sucrose operon repressor  30.52 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00007545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3916  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02609  hypothetical protein  28.44 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02648  L-fuculose phosphate aldolase  28.16 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  34.29 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  27.34 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  23.72 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  26.28 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0874  transcriptional regulator, LacI family  28.34 
 
 		 339 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  33.49 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.75 
 
 		 356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  30.65 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  27.7 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  27.7 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  29.47 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5093  transcriptional regulator, LacI family  26.69 
 
 		 343 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.25 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6362  transcriptional regulator, LacI family  29.86 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  25.82 
 
 		 344 aa  109  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.96 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  30.91 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  26.15 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3944  transcriptional regulator, LacI family  23.57 
 
 		 346 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1464  transcriptional regulator, LacI family  24.4 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  25.71 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2710  regulatory protein, LacI  27.83 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1892  transcriptional regulator, LacI family  23.93 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.72 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1526  transcriptional regulator, LacI family  25.18 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.291045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  27.59 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  26.81 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  28.92 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  23.32 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  27.83 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  27.7 
 
 		 329 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  24.53 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  27.11 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  24.17 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  25.61 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.13 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3542  transcriptional regulator, LacI family  21.12 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  27.91 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3654  LacI family transcription regulator  25.17 
 
 		 354 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  27.78 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  27.64 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4466  LacI family transcription regulator  25.88 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  25.61 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1896  sugar-binding transcriptional regulator RegR  25.68 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.150149  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  23.8 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.72 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  26.5 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0669  LacI family sucrose operon repressor  26.15 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0719  sucrose operon repressor  26.15 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>