More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2811 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2811  regulatory protein LacI  100 
 
 		 412 aa  849    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5308  transcriptional regulator, LacI family  47.51 
 
 		 352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4614  transcriptional regulator, LacI family  48.39 
 
 		 352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3640  regulatory protein LacI  44.78 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0787  LacI family transcription regulator  43.71 
 
 		 375 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0239  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  42.77 
 
 		 351 aa  280  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0263  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  42.48 
 
 		 351 aa  279  6e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3558  LacI family transcription regulator  43.5 
 
 		 354 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7379  transcriptional regulator LacI family  42.2 
 
 		 347 aa  272  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144359  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3435  regulatory protein, LacI  41.64 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3700  LacI family transcription regulator  41.64 
 
 		 337 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0347  transcriptional regulator, LacI family  29.28 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.427458  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4207  LacI family transcription regulator  28.97 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0391  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.133972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3759  transcriptional regulator, LacI family  28.28 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.899629  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3596  transcriptional regulator, LacI family  27.25 
 
 		 339 aa  126  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.75 
 
 		 354 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2023  LacI family transcription regulator  26.65 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2909  sucrose operon repressor  27.19 
 
 		 335 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00007545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  31.02 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.56 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3916  transcriptional regulator, LacI family  27 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  31.15 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.17 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4401  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.56 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.23 
 
 		 337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.04 
 
 		 349 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0820  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.1 
 
 		 331 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2929  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.3 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3399  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.3 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3529  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.3 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0953  fructose repressor FruR, putative  26.48 
 
 		 331 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3603  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.19 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  30.43 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0750  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.3 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02609  hypothetical protein  26.07 
 
 		 332 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3791  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.56 
 
 		 334 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  27.63 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  35.63 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3761  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.71 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2029  transcriptional regulator, LacI family  26.61 
 
 		 343 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3162  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  35.06 
 
 		 329 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.82 
 
 		 347 aa  96.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0636  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.22 
 
 		 334 aa  96.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  29.32 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  26.33 
 
 		 333 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0598  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.58 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0072  transcriptional regulator LacI family  26.44 
 
 		 343 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02648  L-fuculose phosphate aldolase  25.97 
 
 		 314 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1039  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 335 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  25.66 
 
 		 327 aa  93.2  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0888  transcriptional regulator, LacI family  40.46 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  25.96 
 
 		 329 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  25.96 
 
 		 329 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3961  transcriptional regulator, LacI family  26.87 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0946705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.06 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12180  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.06 
 
 		 330 aa  92  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382176  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  27.82 
 
 		 344 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  25.97 
 
 		 339 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000221  fructose repressor FruR LacI family  23.96 
 
 		 326 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  30.87 
 
 		 339 aa  90.9  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  26.25 
 
 		 343 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  28.07 
 
 		 357 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  26.15 
 
 		 340 aa  90.1  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.97 
 
 		 330 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0626  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.52 
 
 		 334 aa  89.7  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.800956  normal  0.256043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00081  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.84 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3520  transcriptional regulator, LacI family  24.84 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0073  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.84 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0088  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.84 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936017 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0082  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.84 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3577  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.84 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0086  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.84 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0085  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.84 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00080  hypothetical protein  24.84 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  27.58 
 
 		 348 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  25.68 
 
 		 344 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  32.78 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3376  transcriptional regulator, LacI family  26.06 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1286  LacI family transcription regulator  24.54 
 
 		 338 aa  88.2  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000013505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  26.81 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0134  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.84 
 
 		 334 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.57 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.84 
 
 		 334 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000945493 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0135  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.84 
 
 		 334 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.57 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.57 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0127  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.84 
 
 		 334 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  29.49 
 
 		 337 aa  87.4  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.57 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  24.84 
 
 		 334 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  26.82 
 
 		 358 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 342 aa  87  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.57 
 
 		 342 aa  87  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  24.24 
 
 		 348 aa  87.4  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 337 aa  87.4  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.57 
 
 		 342 aa  87  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  25.45 
 
 		 334 aa  87.4  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0452  DNA-binding transcriptional regulator FruR  25.7 
 
 		 326 aa  87  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>