More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1470 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1470  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 271 aa  558  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.826438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1209  short chain dehydrogenase  85.13 
 
 		 270 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3356  short chain dehydrogenase  65.67 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4362  short chain dehydrogenase  64.93 
 
 		 270 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0228985 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0248  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1964  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1983  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00829881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1588  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0912  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1148  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 264 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382657  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2387  short chain dehydrogenase  44.19 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47060  short chain dehydrogenase  45.76 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3866  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5800  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4503  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4060  short chain dehydrogenase  46.13 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1347  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.371645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741108  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1584  short chain dehydrogenase  41.89 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6247  short chain dehydrogenase  41.89 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893931  normal  0.68092 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6723  short chain dehydrogenase  41.51 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2216  short chain dehydrogenase  39.55 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 		 291 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  29.43 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  29.54 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  29.45 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  29.54 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  29.54 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 314 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  30.92 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  33.83 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  31.75 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  30.15 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  31.63 
 
 		 282 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  29.18 
 
 		 847 aa  99  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 285 aa  95.5  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 274 aa  95.5  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.44 
 
 		 281 aa  95.5  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.96 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.93 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  34.01 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  33.17 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 273 aa  92.4  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 		 268 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 		 268 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 281 aa  92.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  29.48 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  29.46 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  28.63 
 
 		 847 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>