More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1983 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1983  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00829881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0912  short chain dehydrogenase  99.62 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1964  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0248  short chain dehydrogenase  99.62 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1588  short chain dehydrogenase  99.62 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1148  short chain dehydrogenase  99.24 
 
 		 264 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382657  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2387  short chain dehydrogenase  92.8 
 
 		 264 aa  480  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5800  short chain dehydrogenase  73.64 
 
 		 258 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1347  short chain dehydrogenase  72.09 
 
 		 258 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.371645 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3866  short chain dehydrogenase  73.64 
 
 		 258 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4503  short chain dehydrogenase  73.64 
 
 		 258 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47060  short chain dehydrogenase  60.85 
 
 		 259 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4060  short chain dehydrogenase  62.02 
 
 		 259 aa  298  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1470  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.826438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3356  short chain dehydrogenase  47.15 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4362  short chain dehydrogenase  45.04 
 
 		 270 aa  229  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0228985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1209  short chain dehydrogenase  44.7 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2216  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741108  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6723  short chain dehydrogenase  43.19 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1584  short chain dehydrogenase  43.19 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6247  short chain dehydrogenase  43.19 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893931  normal  0.68092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  38.54 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  37.24 
 
 		 283 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  35.85 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0500  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  30.16 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  33.95 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.36 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 281 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.42 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  37.09 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  38.46 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.5 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  36.97 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004148  putative oxidoreductase  33 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0569  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0552  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  29.27 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0554  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0559  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0613  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.191089 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.17 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2528  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.589688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  30.36 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 276 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0572  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1053  short chain dehydrogenase  30.47 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>