197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_25370  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation  100 
 
 
168 aa  320  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0605599  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  39.46 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  37.01 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  38.4 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  36.69 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  47.62 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  34.71 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  42.42 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  41.9 
 
 
114 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
124 aa  61.2  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  43.02 
 
 
132 aa  60.8  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
126 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
128 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  45 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  30.33 
 
 
126 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  30.33 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  37.1 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  37.59 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  31.03 
 
 
143 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  34.68 
 
 
122 aa  57.8  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  31.3 
 
 
124 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  36.55 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 
125 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  41.3 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  41.11 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  37.93 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
124 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  31.9 
 
 
124 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
124 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
124 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  37.5 
 
 
143 aa  55.1  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 
124 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 
124 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 
124 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 
124 aa  54.7  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  37.27 
 
 
127 aa  54.7  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  34.19 
 
 
122 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 
122 aa  54.3  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  38.64 
 
 
127 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  36.08 
 
 
129 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  40.23 
 
 
144 aa  54.3  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  35 
 
 
127 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  33.08 
 
 
131 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  40.86 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
129 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  46.51 
 
 
128 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  29.84 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3030  camphor resistance protein CrcB  40.26 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  39.74 
 
 
122 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  35.56 
 
 
130 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  41.8 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  26.09 
 
 
134 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  34.65 
 
 
125 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  32.79 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  30.3 
 
 
123 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  30.43 
 
 
124 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  31.36 
 
 
123 aa  52.4  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  31.01 
 
 
133 aa  52  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  36.89 
 
 
124 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  34.48 
 
 
107 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  32.52 
 
 
130 aa  51.2  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 
130 aa  51.2  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  36.26 
 
 
129 aa  51.2  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  31.62 
 
 
122 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  29.57 
 
 
124 aa  51.2  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 
124 aa  50.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  38.98 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  30.17 
 
 
118 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  33.85 
 
 
125 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  42.22 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  29.57 
 
 
124 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  34.33 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  33.05 
 
 
122 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  35.44 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  33.05 
 
 
122 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  32.35 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  27.74 
 
 
132 aa  48.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3282  Camphor resistance CrcB protein  37.11 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  39.2 
 
 
115 aa  47.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  36.72 
 
 
129 aa  47.4  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  34.45 
 
 
122 aa  47.4  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
128 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
133 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 
123 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  46.3 
 
 
120 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  33.75 
 
 
124 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  40.22 
 
 
118 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
132 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>