More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22020  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
445 aa  851    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397333  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2897  histidinol dehydrogenase  66.43 
 
 
435 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139237  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5722  histidinol dehydrogenase  69.25 
 
 
438 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10870  histidinol dehydrogenase  65.75 
 
 
444 aa  528  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2960  histidinol dehydrogenase  64.22 
 
 
441 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.362494  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1150  histidinol dehydrogenase  65.44 
 
 
438 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2023  histidinol dehydrogenase  66.89 
 
 
448 aa  521  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.908809  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11615  histidinol dehydrogenase  64.04 
 
 
444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.196616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3063  histidinol dehydrogenase  60.52 
 
 
474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.741163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3122  histidinol dehydrogenase  60.52 
 
 
474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298812  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2907  Histidinol dehydrogenase  63.84 
 
 
435 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563236  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  65.08 
 
 
592 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3079  histidinol dehydrogenase  60.52 
 
 
474 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3242  histidinol dehydrogenase  63.16 
 
 
434 aa  501  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1434  histidinol dehydrogenase  63.76 
 
 
440 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3192  histidinol dehydrogenase  64.2 
 
 
431 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142432  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3422  histidinol dehydrogenase  64.59 
 
 
440 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2804  histidinol dehydrogenase  63.7 
 
 
451 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3613  histidinol dehydrogenase  62.7 
 
 
449 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157148  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22650  histidinol dehydrogenase  62.53 
 
 
440 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331856  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3196  histidinol dehydrogenase  64.11 
 
 
456 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352835  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1089  histidinol dehydrogenase  60.96 
 
 
441 aa  487  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179567  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3181  histidinol dehydrogenase  64.9 
 
 
443 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584457  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1611  histidinol dehydrogenase  63.91 
 
 
440 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5730  histidinol dehydrogenase  61.45 
 
 
450 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1302  histidinol dehydrogenase  62.76 
 
 
441 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1585  histidinol dehydrogenase  60.72 
 
 
458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3997  histidinol dehydrogenase  60.73 
 
 
429 aa  467  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.821981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3045  histidinol dehydrogenase  60.66 
 
 
432 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1916  histidinol dehydrogenase  60.56 
 
 
431 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0152  histidinol dehydrogenase  52.95 
 
 
465 aa  450  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19310  histidinol dehydrogenase  58.49 
 
 
438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1585  histidinol dehydrogenase  59.91 
 
 
458 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3163  histidinol dehydrogenase  61.39 
 
 
435 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0133294  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3027  histidinol dehydrogenase  60.28 
 
 
431 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0409486 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1058  histidinol dehydrogenase  63.14 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.540827  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4260  histidinol dehydrogenase  53.44 
 
 
440 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133237  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  45.16 
 
 
433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  38.18 
 
 
428 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  41.14 
 
 
442 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  38.61 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  38.12 
 
 
440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  43.24 
 
 
435 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  41.59 
 
 
427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  39.26 
 
 
423 aa  308  9e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  42.64 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  38.67 
 
 
428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  36.26 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  39.27 
 
 
442 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  42.63 
 
 
457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  37.39 
 
 
428 aa  301  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  40.89 
 
 
437 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  38 
 
 
430 aa  298  9e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  37.96 
 
 
449 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  37.96 
 
 
449 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  42.96 
 
 
452 aa  297  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  41.96 
 
 
426 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  43.65 
 
 
424 aa  296  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  40.94 
 
 
432 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  44.93 
 
 
425 aa  295  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  38.48 
 
 
434 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  36.99 
 
 
428 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  43.24 
 
 
431 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  42.86 
 
 
422 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  36.93 
 
 
428 aa  291  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  45.52 
 
 
430 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  37.56 
 
 
427 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  41.75 
 
 
425 aa  289  6e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  39.29 
 
 
427 aa  289  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  39.16 
 
 
426 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  42.76 
 
 
436 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  42.35 
 
 
431 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  42.89 
 
 
431 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  43.63 
 
 
441 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  43.9 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  41.34 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  35.84 
 
 
426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  42.26 
 
 
433 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  42.26 
 
 
433 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  37.62 
 
 
433 aa  282  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  44.01 
 
 
447 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  42.22 
 
 
439 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  41.87 
 
 
432 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  41.91 
 
 
430 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2170  histidinol dehydrogenase  40 
 
 
460 aa  280  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  39.44 
 
 
430 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  42.93 
 
 
431 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  42.08 
 
 
432 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  39.75 
 
 
428 aa  278  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  42.45 
 
 
431 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0925  histidinol dehydrogenase  44.1 
 
 
426 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  39.08 
 
 
428 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  42.62 
 
 
446 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  40.34 
 
 
436 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  43.17 
 
 
444 aa  276  6e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  35.84 
 
 
431 aa  276  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  39.36 
 
 
436 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  40.49 
 
 
437 aa  276  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  38.92 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  41.63 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>