More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3027 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1916  histidinol dehydrogenase  84.92 
 
 		 431 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3027  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 431 aa  824    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0409486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2897  histidinol dehydrogenase  64.58 
 
 		 435 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2907  Histidinol dehydrogenase  64.97 
 
 		 435 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3422  histidinol dehydrogenase  64.38 
 
 		 440 aa  521  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1434  histidinol dehydrogenase  64.97 
 
 		 440 aa  521  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1150  histidinol dehydrogenase  63.11 
 
 		 438 aa  518  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3196  histidinol dehydrogenase  64.84 
 
 		 456 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352835  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10870  histidinol dehydrogenase  62.53 
 
 		 444 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5730  histidinol dehydrogenase  60.67 
 
 		 450 aa  494  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2960  histidinol dehydrogenase  59.63 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.362494  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  62.87 
 
 		 592 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22650  histidinol dehydrogenase  60.91 
 
 		 440 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331856  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3192  histidinol dehydrogenase  63.02 
 
 		 431 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3242  histidinol dehydrogenase  62.12 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1611  histidinol dehydrogenase  62.95 
 
 		 440 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1302  histidinol dehydrogenase  61.59 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3045  histidinol dehydrogenase  60.09 
 
 		 432 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3079  histidinol dehydrogenase  56.87 
 
 		 474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2023  histidinol dehydrogenase  62.61 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.908809  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3063  histidinol dehydrogenase  56.87 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.741163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3613  histidinol dehydrogenase  60.32 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3122  histidinol dehydrogenase  56.87 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298812  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1089  histidinol dehydrogenase  58.54 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3163  histidinol dehydrogenase  63.34 
 
 		 435 aa  461  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0133294  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11615  histidinol dehydrogenase  59.5 
 
 		 444 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.196616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2804  histidinol dehydrogenase  59.77 
 
 		 451 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5722  histidinol dehydrogenase  63.53 
 
 		 438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22020  histidinol dehydrogenase  60.28 
 
 		 445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3181  histidinol dehydrogenase  62.61 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19310  histidinol dehydrogenase  58.35 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1058  histidinol dehydrogenase  65.3 
 
 		 448 aa  443  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.540827  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0152  histidinol dehydrogenase  51.7 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3997  histidinol dehydrogenase  57.6 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.821981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1585  histidinol dehydrogenase  58.12 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1585  histidinol dehydrogenase  57.11 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4260  histidinol dehydrogenase  54.59 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133237  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  44.39 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  45.19 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  37.14 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  38.69 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  44.39 
 
 		 446 aa  326  5e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  38.19 
 
 		 427 aa  325  7e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  49.37 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  40.95 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  42.51 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  36.85 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  43.12 
 
 		 422 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0925  histidinol dehydrogenase  49.13 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  44.28 
 
 		 457 aa  322  8e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  37.09 
 
 		 428 aa  322  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  40.87 
 
 		 429 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  45.8 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  36.18 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  40.81 
 
 		 429 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  46.27 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  40.95 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  40.57 
 
 		 429 aa  319  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  41.91 
 
 		 427 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  40.81 
 
 		 429 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  39.39 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  42.86 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  40.57 
 
 		 429 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  40.57 
 
 		 429 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  43.81 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  43.22 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  43.91 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  43.69 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 		 429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  43.44 
 
 		 428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  45.07 
 
 		 416 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  39.25 
 
 		 423 aa  312  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  42.61 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  43.07 
 
 		 428 aa  310  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  39.39 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  42.14 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  38.01 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  39.43 
 
 		 430 aa  310  4e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  44.5 
 
 		 416 aa  310  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  38.19 
 
 		 430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  38.52 
 
 		 428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  41.81 
 
 		 436 aa  308  9e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  39.57 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  36.84 
 
 		 449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  44.81 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  42.07 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  43.32 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  42.86 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  47.13 
 
 		 441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  36.6 
 
 		 449 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  46.35 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  45.48 
 
 		 431 aa  306  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 		 428 aa  305  7e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  40.71 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  43.15 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  45.48 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  43.1 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  43.1 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  40.57 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>