More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_10870  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
444 aa  868    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5722  histidinol dehydrogenase  82.42 
 
 
438 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2960  histidinol dehydrogenase  71.4 
 
 
441 aa  609  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.362494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3079  histidinol dehydrogenase  69.18 
 
 
474 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2023  histidinol dehydrogenase  73.7 
 
 
448 aa  600  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.908809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3122  histidinol dehydrogenase  69.18 
 
 
474 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298812  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3063  histidinol dehydrogenase  69.18 
 
 
474 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.741163  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1150  histidinol dehydrogenase  71 
 
 
438 aa  588  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2897  histidinol dehydrogenase  70.57 
 
 
435 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3613  histidinol dehydrogenase  72.05 
 
 
449 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157148  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11615  histidinol dehydrogenase  70.09 
 
 
444 aa  580  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.196616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2804  histidinol dehydrogenase  71.04 
 
 
451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3422  histidinol dehydrogenase  70.2 
 
 
440 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2907  Histidinol dehydrogenase  70.34 
 
 
435 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563236  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3196  histidinol dehydrogenase  70.25 
 
 
456 aa  569  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352835  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1434  histidinol dehydrogenase  69.91 
 
 
440 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3192  histidinol dehydrogenase  69.5 
 
 
431 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142432  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3181  histidinol dehydrogenase  71.17 
 
 
443 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584457  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3242  histidinol dehydrogenase  68.81 
 
 
434 aa  555  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5730  histidinol dehydrogenase  66.22 
 
 
450 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22650  histidinol dehydrogenase  64.92 
 
 
440 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331856  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  64.32 
 
 
592 aa  523  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22020  histidinol dehydrogenase  65.75 
 
 
445 aa  518  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397333  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1089  histidinol dehydrogenase  61.19 
 
 
441 aa  511  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179567  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3997  histidinol dehydrogenase  62.56 
 
 
429 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.821981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3045  histidinol dehydrogenase  62.7 
 
 
432 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1302  histidinol dehydrogenase  62.41 
 
 
441 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1916  histidinol dehydrogenase  63.99 
 
 
431 aa  491  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1611  histidinol dehydrogenase  63.33 
 
 
440 aa  491  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1585  histidinol dehydrogenase  61.4 
 
 
458 aa  481  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1585  histidinol dehydrogenase  61.38 
 
 
458 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3027  histidinol dehydrogenase  62.53 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0409486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3163  histidinol dehydrogenase  62.53 
 
 
435 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0133294  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0152  histidinol dehydrogenase  53.03 
 
 
465 aa  460  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4260  histidinol dehydrogenase  58.62 
 
 
440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133237  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19310  histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1058  histidinol dehydrogenase  63.21 
 
 
448 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.540827  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  44.84 
 
 
433 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  38.48 
 
 
424 aa  322  9.000000000000001e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  39.34 
 
 
428 aa  318  1e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  39.23 
 
 
427 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  41.27 
 
 
442 aa  317  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  36.74 
 
 
428 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  44.91 
 
 
435 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  38.65 
 
 
428 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  40.61 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  40.61 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  45.11 
 
 
424 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  38.96 
 
 
428 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  40.38 
 
 
429 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  42.86 
 
 
446 aa  310  4e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  40.61 
 
 
429 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  40.61 
 
 
429 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  43.59 
 
 
446 aa  309  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  41.11 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 
429 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  37.62 
 
 
423 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  43.6 
 
 
422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  40.52 
 
 
426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  37.91 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  40.28 
 
 
437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  42.47 
 
 
442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  39.72 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  40.34 
 
 
434 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  43.28 
 
 
416 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0925  histidinol dehydrogenase  46.45 
 
 
426 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  39.72 
 
 
429 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  43.8 
 
 
416 aa  299  5e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  37.89 
 
 
428 aa  299  5e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  39.09 
 
 
428 aa  298  9e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  42.99 
 
 
457 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  38.86 
 
 
429 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  36.92 
 
 
430 aa  296  5e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  41.81 
 
 
426 aa  296  5e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  46.82 
 
 
443 aa  296  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  41.49 
 
 
433 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  42.33 
 
 
425 aa  295  1e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  36.24 
 
 
449 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  44.28 
 
 
445 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  39.27 
 
 
427 aa  295  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  40.4 
 
 
432 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  36.24 
 
 
449 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  40.57 
 
 
426 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  38.63 
 
 
429 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  45.58 
 
 
430 aa  292  8e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  39.21 
 
 
427 aa  292  8e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 
427 aa  292  9e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  42.93 
 
 
439 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  40.47 
 
 
429 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  43.07 
 
 
452 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  40.42 
 
 
429 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  40.94 
 
 
429 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  38.52 
 
 
454 aa  289  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  39.43 
 
 
436 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  35.08 
 
 
428 aa  287  2e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  36.19 
 
 
424 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0863  histidinol dehydrogenase  37.12 
 
 
426 aa  288  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.998875  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  45.11 
 
 
434 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  43.95 
 
 
425 aa  287  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  45.11 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>