More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3422 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3196  histidinol dehydrogenase  91.36 
 
 
456 aa  786    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352835  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3422  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
440 aa  864    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2897  histidinol dehydrogenase  70.62 
 
 
435 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2907  Histidinol dehydrogenase  69.25 
 
 
435 aa  581  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563236  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1150  histidinol dehydrogenase  69.63 
 
 
438 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10870  histidinol dehydrogenase  70.2 
 
 
444 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1434  histidinol dehydrogenase  69.72 
 
 
440 aa  570  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3242  histidinol dehydrogenase  69.63 
 
 
434 aa  570  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3192  histidinol dehydrogenase  69.35 
 
 
431 aa  566  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142432  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2960  histidinol dehydrogenase  67.73 
 
 
441 aa  554  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.362494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3079  histidinol dehydrogenase  64.3 
 
 
474 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5730  histidinol dehydrogenase  66.52 
 
 
450 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3063  histidinol dehydrogenase  64.3 
 
 
474 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.741163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3122  histidinol dehydrogenase  64.3 
 
 
474 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298812  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1611  histidinol dehydrogenase  68.18 
 
 
440 aa  534  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5722  histidinol dehydrogenase  69.86 
 
 
438 aa  531  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  64.69 
 
 
592 aa  528  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11615  histidinol dehydrogenase  65.75 
 
 
444 aa  526  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.196616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3613  histidinol dehydrogenase  65.16 
 
 
449 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157148  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3997  histidinol dehydrogenase  64.14 
 
 
429 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.821981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2804  histidinol dehydrogenase  65.38 
 
 
451 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2023  histidinol dehydrogenase  67.58 
 
 
448 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.908809  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22650  histidinol dehydrogenase  62.73 
 
 
440 aa  518  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331856  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3181  histidinol dehydrogenase  67.28 
 
 
443 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584457  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1302  histidinol dehydrogenase  62.95 
 
 
441 aa  508  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3045  histidinol dehydrogenase  63.18 
 
 
432 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3163  histidinol dehydrogenase  64.16 
 
 
435 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0133294  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1089  histidinol dehydrogenase  61.5 
 
 
441 aa  498  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179567  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3027  histidinol dehydrogenase  64.38 
 
 
431 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0409486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22020  histidinol dehydrogenase  64.59 
 
 
445 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1916  histidinol dehydrogenase  62.93 
 
 
431 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0152  histidinol dehydrogenase  54.2 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1585  histidinol dehydrogenase  58.12 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1585  histidinol dehydrogenase  59.02 
 
 
458 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123031 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4260  histidinol dehydrogenase  59.13 
 
 
440 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133237  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19310  histidinol dehydrogenase  57.53 
 
 
438 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1058  histidinol dehydrogenase  63.45 
 
 
448 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.540827  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  44.09 
 
 
426 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  45.59 
 
 
435 aa  315  9e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  43.3 
 
 
430 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  39.37 
 
 
427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  36.38 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  43.65 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  36.58 
 
 
424 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  43.95 
 
 
422 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  44.34 
 
 
433 aa  309  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  39.49 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  42.49 
 
 
452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  36.38 
 
 
428 aa  306  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  37.68 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  46.02 
 
 
439 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  38.73 
 
 
423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  42.4 
 
 
442 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  38.72 
 
 
432 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  39.35 
 
 
427 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  44.14 
 
 
424 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  45.33 
 
 
443 aa  302  9e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  35.43 
 
 
440 aa  302  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  43.48 
 
 
434 aa  301  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  38.94 
 
 
429 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  41.35 
 
 
427 aa  299  5e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  37.16 
 
 
428 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 
449 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 
429 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  37.84 
 
 
449 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  43.54 
 
 
457 aa  297  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  39.39 
 
 
429 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 
429 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  38.22 
 
 
429 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0925  histidinol dehydrogenase  47.2 
 
 
426 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  38.11 
 
 
429 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  38.11 
 
 
429 aa  295  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 
429 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4273  histidinol dehydrogenase  45.02 
 
 
438 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.0324123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 
429 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  42.29 
 
 
432 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  37.26 
 
 
428 aa  294  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  38.02 
 
 
429 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  44.67 
 
 
445 aa  293  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  39.34 
 
 
437 aa  292  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  42.93 
 
 
429 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  41.58 
 
 
442 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  42.26 
 
 
425 aa  291  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  46.19 
 
 
430 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  39.29 
 
 
426 aa  290  4e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  38.34 
 
 
434 aa  288  9e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  38.06 
 
 
430 aa  288  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  44.63 
 
 
425 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  44.17 
 
 
446 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  41.67 
 
 
435 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  38.06 
 
 
430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  43.31 
 
 
436 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  41.95 
 
 
429 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 
424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  40.32 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  42.75 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  37.06 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  43.6 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  44.86 
 
 
431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  43.6 
 
 
430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>