More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1089 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22650  histidinol dehydrogenase  72.89 
 
 		 440 aa  640    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331856  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1089  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 441 aa  880    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1302  histidinol dehydrogenase  71.53 
 
 		 441 aa  591  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1611  histidinol dehydrogenase  71.3 
 
 		 440 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  67.35 
 
 		 592 aa  566  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0152  histidinol dehydrogenase  61.14 
 
 		 465 aa  529  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2897  histidinol dehydrogenase  62.5 
 
 		 435 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139237  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1150  histidinol dehydrogenase  63.55 
 
 		 438 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3192  histidinol dehydrogenase  63.41 
 
 		 431 aa  511  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10870  histidinol dehydrogenase  61.19 
 
 		 444 aa  511  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2907  Histidinol dehydrogenase  60 
 
 		 435 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1434  histidinol dehydrogenase  61.96 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3422  histidinol dehydrogenase  61.5 
 
 		 440 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1585  histidinol dehydrogenase  62.64 
 
 		 458 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1585  histidinol dehydrogenase  62.95 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2960  histidinol dehydrogenase  60.36 
 
 		 441 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.362494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3997  histidinol dehydrogenase  60.82 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.821981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3079  histidinol dehydrogenase  58.24 
 
 		 474 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3063  histidinol dehydrogenase  58.33 
 
 		 474 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.741163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3242  histidinol dehydrogenase  59.68 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3122  histidinol dehydrogenase  58.33 
 
 		 474 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298812  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5730  histidinol dehydrogenase  59.19 
 
 		 450 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3196  histidinol dehydrogenase  60.09 
 
 		 456 aa  488  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352835  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11615  histidinol dehydrogenase  59.86 
 
 		 444 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.196616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5722  histidinol dehydrogenase  60.82 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3613  histidinol dehydrogenase  59.33 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22020  histidinol dehydrogenase  60.96 
 
 		 445 aa  477  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3181  histidinol dehydrogenase  61.73 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2804  histidinol dehydrogenase  59.33 
 
 		 451 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2023  histidinol dehydrogenase  59.41 
 
 		 448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.908809  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3045  histidinol dehydrogenase  56.04 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1916  histidinol dehydrogenase  58.22 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19310  histidinol dehydrogenase  56.88 
 
 		 438 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3027  histidinol dehydrogenase  58.54 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0409486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3163  histidinol dehydrogenase  56.49 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0133294  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1058  histidinol dehydrogenase  59.75 
 
 		 448 aa  405  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.540827  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4260  histidinol dehydrogenase  52.85 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133237  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  40.62 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  36.18 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  36.62 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 		 428 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  41.16 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  36.27 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 428 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  41.61 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  38.73 
 
 		 423 aa  295  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  37.71 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  37.71 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  37.81 
 
 		 430 aa  293  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  42.07 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0925  histidinol dehydrogenase  44.07 
 
 		 426 aa  290  5.0000000000000004e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  39.21 
 
 		 442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  41.33 
 
 		 425 aa  290  5.0000000000000004e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  42.75 
 
 		 445 aa  289  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  41.61 
 
 		 433 aa  289  8e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  42.22 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  44.33 
 
 		 443 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  39.13 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  37.65 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  41.82 
 
 		 457 aa  283  3.0000000000000004e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  38.27 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  36.93 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  40.67 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  37.18 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0450  histidinol dehydrogenase  42.01 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.722983  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  38.53 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  39.31 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  43.81 
 
 		 431 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  41 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  41.5 
 
 		 431 aa  279  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  36.74 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  41.44 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  41.3 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  37.86 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  41.61 
 
 		 426 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  42.55 
 
 		 438 aa  276  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  42 
 
 		 434 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  39.36 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  42 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  39.76 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  38.95 
 
 		 427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  43.5 
 
 		 430 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 		 428 aa  274  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  41.54 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  40.72 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  37.12 
 
 		 431 aa  273  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  40.59 
 
 		 431 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  38.79 
 
 		 426 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  37.21 
 
 		 424 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 		 425 aa  273  6e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 		 427 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  36.99 
 
 		 424 aa  272  9e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  39.64 
 
 		 432 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  39.24 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  41.82 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0863  histidinol dehydrogenase  36.02 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.998875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  40.38 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  39.01 
 
 		 429 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  41.38 
 
 		 416 aa  270  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  41.56 
 
 		 437 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>