More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1089  histidinol dehydrogenase  72.89 
 
 		 441 aa  640    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22650  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 440 aa  861    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331856  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1611  histidinol dehydrogenase  75.91 
 
 		 440 aa  627  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  71.3 
 
 		 592 aa  604  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1302  histidinol dehydrogenase  71.59 
 
 		 441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10870  histidinol dehydrogenase  64.92 
 
 		 444 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2897  histidinol dehydrogenase  65 
 
 		 435 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139237  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0152  histidinol dehydrogenase  62.01 
 
 		 465 aa  537  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1150  histidinol dehydrogenase  64.09 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3192  histidinol dehydrogenase  65.15 
 
 		 431 aa  524  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3422  histidinol dehydrogenase  62.73 
 
 		 440 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1585  histidinol dehydrogenase  65.68 
 
 		 458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2907  Histidinol dehydrogenase  62.95 
 
 		 435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1434  histidinol dehydrogenase  64.55 
 
 		 440 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2960  histidinol dehydrogenase  60.45 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.362494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1585  histidinol dehydrogenase  64.07 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11615  histidinol dehydrogenase  62.73 
 
 		 444 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.196616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3196  histidinol dehydrogenase  61.36 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352835  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5730  histidinol dehydrogenase  61.61 
 
 		 450 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3063  histidinol dehydrogenase  58.58 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.741163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3079  histidinol dehydrogenase  58.71 
 
 		 474 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3122  histidinol dehydrogenase  58.58 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298812  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2804  histidinol dehydrogenase  62.61 
 
 		 451 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3613  histidinol dehydrogenase  61.94 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3242  histidinol dehydrogenase  60 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2023  histidinol dehydrogenase  64.24 
 
 		 448 aa  488  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.908809  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22020  histidinol dehydrogenase  62.53 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5722  histidinol dehydrogenase  62.27 
 
 		 438 aa  481  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3181  histidinol dehydrogenase  64.24 
 
 		 443 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3997  histidinol dehydrogenase  59.32 
 
 		 429 aa  478  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.821981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3045  histidinol dehydrogenase  59.77 
 
 		 432 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19310  histidinol dehydrogenase  60 
 
 		 438 aa  477  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1916  histidinol dehydrogenase  61.73 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3027  histidinol dehydrogenase  60.91 
 
 		 431 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0409486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3163  histidinol dehydrogenase  59.77 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0133294  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4260  histidinol dehydrogenase  56.64 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133237  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1058  histidinol dehydrogenase  59.95 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.540827  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  37.7 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  43.55 
 
 		 424 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  36.72 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  45.43 
 
 		 445 aa  311  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  43.83 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  42.48 
 
 		 435 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  41.15 
 
 		 446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  36.72 
 
 		 428 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  39.39 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  40.68 
 
 		 430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  39.81 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  36.45 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  43.8 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 		 423 aa  299  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  35.1 
 
 		 440 aa  298  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  41.15 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  43.52 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0925  histidinol dehydrogenase  45.32 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  46.79 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  40.54 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  44.71 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  36.47 
 
 		 449 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  43.78 
 
 		 452 aa  293  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  44.82 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  36.47 
 
 		 449 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  40.67 
 
 		 425 aa  292  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  46.88 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  39.28 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  39.67 
 
 		 427 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  41.16 
 
 		 434 aa  289  7e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  40.65 
 
 		 442 aa  289  7e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  39.67 
 
 		 437 aa  289  7e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  37.87 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  36.88 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  39.52 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  39.07 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  39.13 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  38.89 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  38.8 
 
 		 429 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  38.89 
 
 		 429 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  38.65 
 
 		 429 aa  285  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  38.89 
 
 		 429 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  38.89 
 
 		 429 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  38.8 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  36.3 
 
 		 428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  39.26 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  40.69 
 
 		 426 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  42.23 
 
 		 425 aa  282  7.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  43.17 
 
 		 438 aa  282  8.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  40 
 
 		 433 aa  282  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  37.3 
 
 		 427 aa  282  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  40.89 
 
 		 427 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  42.36 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  42.03 
 
 		 431 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  44.47 
 
 		 431 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  38.63 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  37.56 
 
 		 430 aa  279  6e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0450  histidinol dehydrogenase  40.93 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.722983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  41.63 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  40.51 
 
 		 428 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  43.99 
 
 		 431 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  38.13 
 
 		 428 aa  277  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>