More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3181 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3181  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
443 aa  857    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584457  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10870  histidinol dehydrogenase  71.85 
 
 
444 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2897  histidinol dehydrogenase  71.85 
 
 
435 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2907  Histidinol dehydrogenase  72.02 
 
 
435 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563236  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1434  histidinol dehydrogenase  72.08 
 
 
440 aa  589  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1150  histidinol dehydrogenase  70.64 
 
 
438 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3192  histidinol dehydrogenase  71.26 
 
 
431 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142432  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5730  histidinol dehydrogenase  69.37 
 
 
450 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3242  histidinol dehydrogenase  68.58 
 
 
434 aa  553  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3422  histidinol dehydrogenase  67.28 
 
 
440 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5722  histidinol dehydrogenase  72.94 
 
 
438 aa  552  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2960  histidinol dehydrogenase  65.9 
 
 
441 aa  548  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.362494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3196  histidinol dehydrogenase  66.59 
 
 
456 aa  545  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352835  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3079  histidinol dehydrogenase  63.23 
 
 
474 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3063  histidinol dehydrogenase  63.23 
 
 
474 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.741163  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2023  histidinol dehydrogenase  67.57 
 
 
448 aa  538  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.908809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3122  histidinol dehydrogenase  63.23 
 
 
474 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298812  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3045  histidinol dehydrogenase  65.68 
 
 
432 aa  537  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3613  histidinol dehydrogenase  65.45 
 
 
449 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157148  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11615  histidinol dehydrogenase  65.14 
 
 
444 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.196616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2804  histidinol dehydrogenase  66.14 
 
 
451 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22650  histidinol dehydrogenase  64.24 
 
 
440 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331856  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  65.6 
 
 
592 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22020  histidinol dehydrogenase  64.9 
 
 
445 aa  508  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397333  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1611  histidinol dehydrogenase  65.83 
 
 
440 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1089  histidinol dehydrogenase  61.73 
 
 
441 aa  498  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179567  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1585  histidinol dehydrogenase  62.81 
 
 
458 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1302  histidinol dehydrogenase  64.46 
 
 
441 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1585  histidinol dehydrogenase  63.62 
 
 
458 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3997  histidinol dehydrogenase  62.01 
 
 
429 aa  488  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.821981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3163  histidinol dehydrogenase  65.3 
 
 
435 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0133294  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1916  histidinol dehydrogenase  61.61 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0152  histidinol dehydrogenase  55.05 
 
 
465 aa  467  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19310  histidinol dehydrogenase  60.09 
 
 
438 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3027  histidinol dehydrogenase  62.61 
 
 
431 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0409486 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4260  histidinol dehydrogenase  60.42 
 
 
440 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133237  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1058  histidinol dehydrogenase  65.12 
 
 
448 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.540827  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  46.45 
 
 
446 aa  327  3e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  37.27 
 
 
428 aa  322  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  44.39 
 
 
442 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  38.33 
 
 
428 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  39.01 
 
 
440 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  39.24 
 
 
449 aa  312  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  38.71 
 
 
427 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  41.67 
 
 
430 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 
449 aa  312  9e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  45.79 
 
 
435 aa  312  9e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  37.78 
 
 
428 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  36.83 
 
 
424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  45.54 
 
 
424 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  41.98 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  41.98 
 
 
429 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  41.98 
 
 
429 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  41.98 
 
 
429 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  41.73 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  43.84 
 
 
422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  42.08 
 
 
429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  40.32 
 
 
437 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  41.76 
 
 
426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  43.53 
 
 
446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  38.12 
 
 
430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  41.58 
 
 
429 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  43.93 
 
 
434 aa  302  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  42.08 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  38.53 
 
 
428 aa  301  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  46.39 
 
 
434 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  43.9 
 
 
432 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  46.39 
 
 
434 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  45.89 
 
 
439 aa  299  6e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  36.73 
 
 
428 aa  298  9e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  42.79 
 
 
457 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  39.5 
 
 
429 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  38.88 
 
 
423 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  43.37 
 
 
433 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  47.04 
 
 
443 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  41.09 
 
 
427 aa  297  3e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  41.65 
 
 
427 aa  295  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  38.55 
 
 
434 aa  295  9e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  44.34 
 
 
425 aa  295  9e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  40 
 
 
429 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  40.67 
 
 
427 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  48.91 
 
 
429 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  41.98 
 
 
433 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  39.51 
 
 
432 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  44.58 
 
 
436 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0925  histidinol dehydrogenase  47.37 
 
 
426 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  41.09 
 
 
429 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  44.9 
 
 
434 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  41.42 
 
 
441 aa  293  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  40.84 
 
 
454 aa  292  7e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  42.4 
 
 
434 aa  292  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  41.55 
 
 
436 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  44.26 
 
 
431 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  45.3 
 
 
430 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  41.34 
 
 
429 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  37.36 
 
 
430 aa  290  3e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  38.92 
 
 
433 aa  290  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  42.12 
 
 
441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  36.85 
 
 
430 aa  289  6e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  44.47 
 
 
434 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>