More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2170 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2170  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
460 aa  929    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  44.03 
 
 
424 aa  378  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  44.63 
 
 
427 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 
432 aa  372  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  45.86 
 
 
429 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  47.77 
 
 
430 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  46.78 
 
 
454 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  46.75 
 
 
424 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  45.27 
 
 
434 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  47.85 
 
 
426 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  46.62 
 
 
427 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  46.75 
 
 
422 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  45.89 
 
 
429 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  46.37 
 
 
437 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  45.36 
 
 
429 aa  359  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  45.11 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  45.36 
 
 
429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  45.11 
 
 
429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  43.72 
 
 
428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  44.89 
 
 
429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  48.35 
 
 
432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  47.43 
 
 
429 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  47.56 
 
 
435 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  46.52 
 
 
429 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  45.11 
 
 
429 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  45.11 
 
 
429 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  44.64 
 
 
429 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  48.86 
 
 
424 aa  354  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  47.12 
 
 
441 aa  353  5e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  48 
 
 
436 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  46.52 
 
 
434 aa  352  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  45.95 
 
 
433 aa  349  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  46.02 
 
 
429 aa  349  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  46.19 
 
 
436 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  47.3 
 
 
439 aa  346  5e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  44.08 
 
 
423 aa  346  6e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  45.5 
 
 
434 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  45.59 
 
 
425 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  48.17 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  46.67 
 
 
429 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  49.38 
 
 
430 aa  342  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  45.84 
 
 
426 aa  341  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  44.03 
 
 
431 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  44.84 
 
 
430 aa  340  4e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  44.84 
 
 
442 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  44.7 
 
 
427 aa  338  8e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  44.55 
 
 
428 aa  339  8e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  44.25 
 
 
449 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  44.25 
 
 
449 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  40.8 
 
 
428 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  41.34 
 
 
428 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  47.15 
 
 
431 aa  336  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  47.64 
 
 
431 aa  336  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  42.21 
 
 
428 aa  335  9e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  46.85 
 
 
430 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  44.03 
 
 
434 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  44.5 
 
 
457 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  44.17 
 
 
435 aa  333  3e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  47.64 
 
 
431 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  48.3 
 
 
432 aa  333  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  43.83 
 
 
446 aa  332  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  40.8 
 
 
440 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  45 
 
 
430 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1332  histidinol dehydrogenase  43.54 
 
 
435 aa  329  8e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  46.21 
 
 
445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  45.09 
 
 
428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  43.28 
 
 
427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  44.89 
 
 
436 aa  326  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  44.08 
 
 
428 aa  323  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  45.91 
 
 
431 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  44.36 
 
 
425 aa  323  3e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  41.52 
 
 
427 aa  324  3e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  45.66 
 
 
432 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  44.08 
 
 
452 aa  323  4e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  42.68 
 
 
430 aa  323  6e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2305  histidinol dehydrogenase  39.7 
 
 
414 aa  322  8e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  44.08 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  42.61 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  44.08 
 
 
430 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  41.65 
 
 
428 aa  320  3e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1370  histidinol dehydrogenase  43.75 
 
 
436 aa  319  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304099  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  44.91 
 
 
434 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  45.05 
 
 
433 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0925  histidinol dehydrogenase  45.91 
 
 
426 aa  316  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1767  histidinol dehydrogenase  41.79 
 
 
428 aa  316  6e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  42.16 
 
 
432 aa  316  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  41.79 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  44.77 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  41.94 
 
 
430 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  43.73 
 
 
433 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  42.43 
 
 
430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  44.31 
 
 
434 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  44.28 
 
 
433 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  42 
 
 
428 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  46.72 
 
 
437 aa  312  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  42.93 
 
 
428 aa  312  7.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  46.4 
 
 
444 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  44.58 
 
 
434 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0753  histidinol dehydrogenase  45.05 
 
 
473 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  45.25 
 
 
436 aa  311  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>