More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6447 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6447  porin  100 
 
 		 366 aa  724    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5946  porin  99.45 
 
 		 388 aa  725    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5582  porin  99.45 
 
 		 388 aa  725    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7455  outer membrane protein (porin)  90.3 
 
 		 388 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  44.42 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  45.94 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  46.31 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  44.05 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  44.85 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  45.34 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  46.86 
 
 		 385 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  45.69 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  42.97 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  43.08 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  42.89 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  42.89 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  43.57 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  43.57 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  43.57 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  43.57 
 
 		 411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  43.57 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  43.57 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  42.63 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  43.57 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  43.11 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  43.11 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  43.11 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  43.11 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  43.11 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  42.93 
 
 		 523 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  42.49 
 
 		 388 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  42.56 
 
 		 394 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  42.71 
 
 		 386 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  41.24 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  41.3 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  41.54 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  41.07 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  41.07 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  41.07 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  41.07 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  41.07 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  41.07 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  41.07 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  39.79 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  41.54 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  41.54 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  41.54 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  41.18 
 
 		 390 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  41.79 
 
 		 390 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  39.64 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  39.64 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  40.05 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  40.66 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  41.38 
 
 		 376 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  41.38 
 
 		 376 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  38.58 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  40.85 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  41.11 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  39.63 
 
 		 376 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  41.11 
 
 		 398 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  40.41 
 
 		 395 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  40.7 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  36.75 
 
 		 391 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  36.59 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  36.59 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  40.7 
 
 		 395 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  36.59 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  36.59 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  40.41 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  36.59 
 
 		 399 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.6 
 
 		 389 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  38.56 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  37.5 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  37.5 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  37.5 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  38.3 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  37.18 
 
 		 397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  38.05 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  38.71 
 
 		 379 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  39.89 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  38.98 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  38.87 
 
 		 380 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  38.89 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  38.71 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  39.02 
 
 		 383 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  37.28 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  38.64 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  37.34 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  38.02 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  36.22 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  38.5 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  37.69 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  38.5 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  38.14 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  38.24 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  36.67 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  39.74 
 
 		 403 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  35.57 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  36.81 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  37.8 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>