More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5946 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6447  porin  99.45 
 
 		 366 aa  725    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5582  porin  100 
 
 		 388 aa  768    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5946  porin  100 
 
 		 388 aa  768    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7455  outer membrane protein (porin)  90.72 
 
 		 388 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  45.76 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  43.96 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  45.17 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  43.99 
 
 		 404 aa  278  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  44.84 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  42.96 
 
 		 386 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  43.2 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  43.2 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  42.96 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  42.96 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  45.1 
 
 		 385 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  45.6 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  47.14 
 
 		 385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  42.58 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  43.31 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  43.23 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  43.42 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  44.09 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  43.42 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  44.09 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  44.09 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  44.09 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  44.09 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  44.09 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  43.16 
 
 		 385 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  44.09 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  43.46 
 
 		 523 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  42.07 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  43.01 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  40.4 
 
 		 386 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  41.24 
 
 		 386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  40.24 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  40.24 
 
 		 430 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  40 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  40 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  40 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  40 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  40 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  39.31 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  41.58 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  39.02 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  40.29 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  40.05 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  41 
 
 		 376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  41 
 
 		 376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  41.54 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  39.64 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  41.79 
 
 		 390 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  39.64 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  41.54 
 
 		 390 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  41.54 
 
 		 390 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  40.5 
 
 		 376 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  38.1 
 
 		 389 aa  223  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  40.22 
 
 		 395 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.67 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  41.11 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  38.65 
 
 		 376 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  40.5 
 
 		 395 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  40.5 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  36.91 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  36.91 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  36.91 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  36.79 
 
 		 391 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  36.91 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  38.96 
 
 		 394 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  41.11 
 
 		 398 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  36.91 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  38.63 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  38.39 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  36.87 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  36.87 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  39.07 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  36.8 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  37.75 
 
 		 391 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  37.07 
 
 		 397 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  39.59 
 
 		 380 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  38.57 
 
 		 383 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  38.57 
 
 		 383 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  38.69 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  36.89 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  38.3 
 
 		 445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  39.04 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  39.04 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  38.08 
 
 		 383 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  35.52 
 
 		 389 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  38.77 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  39.04 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  37.44 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  37.78 
 
 		 379 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  38.24 
 
 		 391 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  36.74 
 
 		 397 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  38.46 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  35.96 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  37.99 
 
 		 393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  37.33 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  36.17 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>