125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4455 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  68.53 
 
 		 605 aa  716    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  68.53 
 
 		 635 aa  718    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  65.47 
 
 		 630 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  67.27 
 
 		 636 aa  712    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  66.01 
 
 		 630 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  64.94 
 
 		 645 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  66.01 
 
 		 630 aa  680    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  68.53 
 
 		 635 aa  718    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  69.16 
 
 		 563 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  68.35 
 
 		 605 aa  715    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  68.35 
 
 		 605 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  68.53 
 
 		 605 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  64.81 
 
 		 631 aa  643    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  66.19 
 
 		 630 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1188    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  65.12 
 
 		 645 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  58.29 
 
 		 648 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  60 
 
 		 668 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  36.89 
 
 		 569 aa  261  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  32.39 
 
 		 660 aa  250  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  32.38 
 
 		 674 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  31.61 
 
 		 674 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 		 558 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  30.95 
 
 		 552 aa  144  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  26.68 
 
 		 600 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  25.32 
 
 		 596 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  25.97 
 
 		 598 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  25.81 
 
 		 596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  24.71 
 
 		 582 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  24.49 
 
 		 582 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  24.32 
 
 		 605 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  25.08 
 
 		 593 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  24.15 
 
 		 582 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  24.15 
 
 		 582 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  24.15 
 
 		 582 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  24.15 
 
 		 582 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  24.5 
 
 		 610 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  24.62 
 
 		 585 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  24.37 
 
 		 610 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  24.37 
 
 		 610 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  24.37 
 
 		 585 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  23.87 
 
 		 605 aa  97.1  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  25.04 
 
 		 572 aa  96.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  23.99 
 
 		 604 aa  95.1  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  24.04 
 
 		 585 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  24.17 
 
 		 585 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  23.73 
 
 		 572 aa  87.4  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  22.61 
 
 		 601 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  32.67 
 
 		 540 aa  78.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  22.58 
 
 		 613 aa  77  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.26 
 
 		 555 aa  70.5  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.15 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.15 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.15 
 
 		 554 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 		 550 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  36.96 
 
 		 581 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.23 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.32 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.55 
 
 		 550 aa  57  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.32 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  24.32 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.32 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  24.32 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.32 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.6 
 
 		 556 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.01 
 
 		 550 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  39.78 
 
 		 519 aa  54.3  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  30.59 
 
 		 575 aa  54.3  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  29.44 
 
 		 587 aa  54.3  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.7 
 
 		 546 aa  54.3  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.89 
 
 		 550 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  22.99 
 
 		 552 aa  53.9  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 601 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18330  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.7 
 
 		 549 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0521799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.11 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 564 aa  52.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.58 
 
 		 553 aa  52.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.11 
 
 		 548 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.11 
 
 		 548 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.35 
 
 		 549 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0521  glycosyl transferase family protein  41.07 
 
 		 576 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.309275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.11 
 
 		 548 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.08 
 
 		 556 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 		 557 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 		 574 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  26.95 
 
 		 541 aa  51.2  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.11 
 
 		 548 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  27.62 
 
 		 535 aa  50.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  27.62 
 
 		 535 aa  50.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 477 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  22.92 
 
 		 574 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  27.65 
 
 		 561 aa  50.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  40.85 
 
 		 540 aa  50.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  22.19 
 
 		 574 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 		 603 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  26.2 
 
 		 616 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 553 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  31.1 
 
 		 575 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>