72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2033 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  61.88 
 
 
630 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  64.51 
 
 
645 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  63.65 
 
 
630 aa  708    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  63.65 
 
 
630 aa  708    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  63.05 
 
 
635 aa  728    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  68.71 
 
 
668 aa  796    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  65.56 
 
 
563 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  63.92 
 
 
605 aa  724    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  63.92 
 
 
605 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  63.73 
 
 
636 aa  713    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  63.92 
 
 
605 aa  724    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  65.64 
 
 
631 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  63.82 
 
 
630 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  63.05 
 
 
635 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  62.28 
 
 
645 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  100 
 
 
648 aa  1292    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  63.92 
 
 
605 aa  724    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  59.16 
 
 
599 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  31.8 
 
 
674 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  31.52 
 
 
674 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  32.37 
 
 
660 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  36.11 
 
 
569 aa  243  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
558 aa  213  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  30.94 
 
 
552 aa  130  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  23.89 
 
 
600 aa  113  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  25.12 
 
 
598 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  24.27 
 
 
596 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  24.15 
 
 
596 aa  95.1  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  23.27 
 
 
585 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  24.45 
 
 
605 aa  90.9  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  24.08 
 
 
605 aa  90.9  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  24.41 
 
 
582 aa  90.5  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  24.83 
 
 
582 aa  90.1  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  25.08 
 
 
601 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  23.99 
 
 
593 aa  87.4  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  24.66 
 
 
582 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  24.66 
 
 
582 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  24.66 
 
 
582 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  24.66 
 
 
582 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  23.6 
 
 
572 aa  80.9  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  24.25 
 
 
613 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  22.65 
 
 
604 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  23.24 
 
 
585 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  23.08 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  23.08 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  23.08 
 
 
610 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  32.73 
 
 
540 aa  70.5  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  22.68 
 
 
585 aa  67  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  21.76 
 
 
585 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  24.05 
 
 
572 aa  60.1  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  30.43 
 
 
519 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  27.19 
 
 
581 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  26.22 
 
 
616 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.07 
 
 
554 aa  51.2  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.07 
 
 
554 aa  51.2  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.07 
 
 
554 aa  51.2  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
493 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  28.25 
 
 
579 aa  50.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.65 
 
 
556 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.76 
 
 
569 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  23.38 
 
 
574 aa  47.4  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
585 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  22.69 
 
 
574 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.36 
 
 
556 aa  45.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 
553 aa  45.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  28.05 
 
 
580 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  26.17 
 
 
561 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0114  hypothetical protein  28.89 
 
 
587 aa  45.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.112922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  22.69 
 
 
574 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.22 
 
 
552 aa  45.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  24.75 
 
 
323 aa  43.9  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  26.06 
 
 
587 aa  43.9  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>