52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4910 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  100 
 
 		 579 aa  1125    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1494  putative inner membrane transmembrane protein  61.47 
 
 		 565 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  61.3 
 
 		 565 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  62.28 
 
 		 581 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0012  putative inner membrane transmembrane protein  61.12 
 
 		 616 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2901  putative inner membrane transmembrane protein  55.85 
 
 		 601 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2198  hypothetical protein  53.7 
 
 		 589 aa  472  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0401619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  52.53 
 
 		 616 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2319  putative inner membrane transmembrane protein  51.3 
 
 		 575 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  47.54 
 
 		 587 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2808  hypothetical protein  49.01 
 
 		 537 aa  379  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  36.76 
 
 		 610 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  35.78 
 
 		 585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  36.59 
 
 		 585 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  36.92 
 
 		 610 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  36.36 
 
 		 585 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  36.92 
 
 		 610 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  36.28 
 
 		 582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  36.28 
 
 		 582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  36.28 
 
 		 582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  36.28 
 
 		 582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  36.28 
 
 		 582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  36.36 
 
 		 585 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  36.28 
 
 		 605 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  36.28 
 
 		 582 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 604 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  35.88 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  35.67 
 
 		 613 aa  291  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  35.38 
 
 		 601 aa  291  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  32.59 
 
 		 596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  32.47 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  32.65 
 
 		 596 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  32.18 
 
 		 572 aa  250  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  31.31 
 
 		 600 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  31.24 
 
 		 593 aa  243  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  31.5 
 
 		 572 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 558 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  28.44 
 
 		 552 aa  87.8  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  25.14 
 
 		 519 aa  84  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  27.3 
 
 		 630 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  27.3 
 
 		 630 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  27.3 
 
 		 630 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  28.66 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  28.66 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  28.83 
 
 		 668 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  28.87 
 
 		 648 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  24.13 
 
 		 630 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  26.64 
 
 		 674 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  26.5 
 
 		 660 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 631 aa  57  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  24.64 
 
 		 674 aa  53.9  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  25.38 
 
 		 599 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>