53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2808 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2808  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1044    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  58.55 
 
 		 587 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  49.01 
 
 		 579 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2901  putative inner membrane transmembrane protein  50.18 
 
 		 601 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  48.73 
 
 		 565 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1494  putative inner membrane transmembrane protein  48.81 
 
 		 565 aa  382  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2198  hypothetical protein  47.87 
 
 		 589 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0401619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  45.77 
 
 		 616 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2319  putative inner membrane transmembrane protein  45.59 
 
 		 575 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0012  putative inner membrane transmembrane protein  50.45 
 
 		 616 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  47.6 
 
 		 581 aa  342  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  34.74 
 
 		 572 aa  313  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  33.8 
 
 		 572 aa  298  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  35.23 
 
 		 585 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  36.79 
 
 		 610 aa  286  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  36.33 
 
 		 601 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  36.61 
 
 		 585 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  36.43 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  36.43 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  35.54 
 
 		 582 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  35.54 
 
 		 582 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  35.54 
 
 		 582 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  35.54 
 
 		 582 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  35.63 
 
 		 613 aa  279  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  35.36 
 
 		 582 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  35.41 
 
 		 605 aa  277  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  35.36 
 
 		 582 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  35.36 
 
 		 605 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  36.07 
 
 		 585 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  36.07 
 
 		 585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 		 604 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  34.59 
 
 		 600 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  34.57 
 
 		 598 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  33.63 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  33.57 
 
 		 596 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  33.75 
 
 		 593 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 		 558 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  29.48 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  28.55 
 
 		 519 aa  100  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  28.08 
 
 		 552 aa  87.8  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  30.12 
 
 		 660 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  25.39 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  28.11 
 
 		 674 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  28.11 
 
 		 674 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  28.28 
 
 		 569 aa  63.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  26.51 
 
 		 648 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  27.35 
 
 		 668 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  27.48 
 
 		 630 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  27.48 
 
 		 630 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  27.48 
 
 		 630 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  26.16 
 
 		 645 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  26.16 
 
 		 645 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  26.49 
 
 		 630 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>