68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3000 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1047    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 		 558 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  36.54 
 
 		 552 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  33.39 
 
 		 598 aa  226  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  33.1 
 
 		 596 aa  223  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  32.98 
 
 		 596 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  31.63 
 
 		 605 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  31.1 
 
 		 605 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  29.33 
 
 		 585 aa  217  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  31.1 
 
 		 582 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  31.1 
 
 		 582 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  30.92 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  30.92 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  30.92 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  30.92 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 604 aa  213  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  30.46 
 
 		 610 aa  211  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  29.84 
 
 		 585 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  30.65 
 
 		 600 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  29.93 
 
 		 610 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  29.93 
 
 		 610 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  30.54 
 
 		 585 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  30.36 
 
 		 585 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  30.23 
 
 		 572 aa  203  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  31.69 
 
 		 593 aa  197  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  30.07 
 
 		 613 aa  193  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  30.05 
 
 		 572 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  30.07 
 
 		 601 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  30.84 
 
 		 569 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  32.44 
 
 		 519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  28.71 
 
 		 660 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  27.71 
 
 		 674 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  29.19 
 
 		 599 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  27.9 
 
 		 674 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  28.33 
 
 		 648 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  30.19 
 
 		 636 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  27.81 
 
 		 668 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  29.35 
 
 		 605 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  29.35 
 
 		 605 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  29.93 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  29.35 
 
 		 605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  29.35 
 
 		 605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  29.35 
 
 		 635 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  29.28 
 
 		 563 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  29.35 
 
 		 635 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  29.03 
 
 		 645 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2808  hypothetical protein  29.76 
 
 		 537 aa  130  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  28.5 
 
 		 645 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  29.17 
 
 		 630 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  29.17 
 
 		 630 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  29.17 
 
 		 630 aa  127  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  29.28 
 
 		 565 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1494  putative inner membrane transmembrane protein  29.28 
 
 		 565 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  29.9 
 
 		 630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  36.43 
 
 		 581 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  32.75 
 
 		 616 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2319  putative inner membrane transmembrane protein  27.84 
 
 		 575 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0012  putative inner membrane transmembrane protein  34.48 
 
 		 616 aa  81.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2198  hypothetical protein  32.04 
 
 		 589 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0401619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 534 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 553 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  48.94 
 
 		 541 aa  50.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  34.15 
 
 		 540 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 522 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.23 
 
 		 555 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  26.6 
 
 		 537 aa  43.9  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  22.7 
 
 		 574 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>