53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2364 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  100 
 
 
565 aa  1087    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1494  putative inner membrane transmembrane protein  99.29 
 
 
565 aa  1079    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  61.3 
 
 
579 aa  595  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  65.79 
 
 
581 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0012  putative inner membrane transmembrane protein  63.41 
 
 
616 aa  551  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672275  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2901  putative inner membrane transmembrane protein  57.52 
 
 
601 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2198  hypothetical protein  56.73 
 
 
589 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0401619  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  54.84 
 
 
616 aa  462  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2319  putative inner membrane transmembrane protein  50.09 
 
 
575 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  50.09 
 
 
587 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2808  hypothetical protein  49.18 
 
 
537 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  38.97 
 
 
585 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  38.42 
 
 
585 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
604 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  36.51 
 
 
585 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  38.63 
 
 
610 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  38.29 
 
 
610 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  38.29 
 
 
610 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  37.31 
 
 
605 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  38.53 
 
 
585 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  38.33 
 
 
582 aa  296  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  38.68 
 
 
582 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  38.68 
 
 
582 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  38.68 
 
 
582 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  38.33 
 
 
582 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  38.68 
 
 
582 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  37.67 
 
 
605 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  35.47 
 
 
598 aa  292  9e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  34.63 
 
 
596 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  36.24 
 
 
613 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  35.31 
 
 
600 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  36.62 
 
 
601 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  33.98 
 
 
596 aa  277  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  34.68 
 
 
593 aa  266  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  32.64 
 
 
572 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  31.46 
 
 
572 aa  244  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  27.91 
 
 
540 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 
558 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  29.03 
 
 
552 aa  92.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  25.68 
 
 
519 aa  74.7  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  26.33 
 
 
660 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  23.36 
 
 
630 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  27.56 
 
 
569 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  27.69 
 
 
635 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  25.17 
 
 
636 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  27.69 
 
 
605 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  27.69 
 
 
563 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  27.69 
 
 
605 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  27.69 
 
 
635 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  27.36 
 
 
605 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  27.36 
 
 
605 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  37.31 
 
 
599 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  24.58 
 
 
668 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>