62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0636 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  88.99 
 
 		 572 aa  1046    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  100 
 
 		 572 aa  1151    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  44.13 
 
 		 596 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  44.31 
 
 		 600 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  44.31 
 
 		 596 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  42.91 
 
 		 598 aa  475  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  43.61 
 
 		 582 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  43.61 
 
 		 582 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  43.61 
 
 		 582 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  43.61 
 
 		 582 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  43.61 
 
 		 582 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  43.61 
 
 		 582 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  43.61 
 
 		 605 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  44.17 
 
 		 605 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  43.61 
 
 		 610 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  43.43 
 
 		 610 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  43.43 
 
 		 610 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  43.26 
 
 		 585 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  42.15 
 
 		 585 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  44.23 
 
 		 593 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  43.08 
 
 		 604 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  42.56 
 
 		 585 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  42.21 
 
 		 585 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  41.74 
 
 		 613 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  41.42 
 
 		 601 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2808  hypothetical protein  33.51 
 
 		 537 aa  249  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  32.05 
 
 		 587 aa  233  9e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2901  putative inner membrane transmembrane protein  32.65 
 
 		 601 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  31.68 
 
 		 565 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1494  putative inner membrane transmembrane protein  31.5 
 
 		 565 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2198  hypothetical protein  31.58 
 
 		 589 aa  206  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0401619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0012  putative inner membrane transmembrane protein  32.53 
 
 		 616 aa  197  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  29.29 
 
 		 540 aa  150  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  33.21 
 
 		 616 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 		 558 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2319  putative inner membrane transmembrane protein  34.51 
 
 		 575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  33.44 
 
 		 581 aa  128  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  27.64 
 
 		 552 aa  125  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  26.24 
 
 		 674 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  25.08 
 
 		 660 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  26.58 
 
 		 569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  25.92 
 
 		 674 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  25.96 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  34.55 
 
 		 579 aa  90.5  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  26.06 
 
 		 645 aa  87.8  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  25.89 
 
 		 645 aa  87  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  25.5 
 
 		 630 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  23.23 
 
 		 599 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  25.34 
 
 		 630 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  25.34 
 
 		 630 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  27.09 
 
 		 605 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  27.09 
 
 		 605 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  27.09 
 
 		 605 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  27.09 
 
 		 605 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  26.93 
 
 		 635 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  27.09 
 
 		 563 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  26.93 
 
 		 635 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  24.83 
 
 		 636 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  24.96 
 
 		 668 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  24.88 
 
 		 630 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 631 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  22.06 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>