63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1370 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1166    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  87.61 
 
 
610 aa  1021    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  86.23 
 
 
585 aa  1009    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  78.16 
 
 
613 aa  910    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  87.61 
 
 
610 aa  1021    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1166    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1166    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  95.53 
 
 
605 aa  1100    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  99.31 
 
 
582 aa  1159    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  99.48 
 
 
582 aa  1161    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  87.61 
 
 
610 aa  1021    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  99.66 
 
 
605 aa  1161    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  85.71 
 
 
604 aa  1001    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  87.44 
 
 
585 aa  1021    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  86.57 
 
 
585 aa  1012    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  77.74 
 
 
585 aa  932    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  77.47 
 
 
601 aa  905    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1166    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  53.68 
 
 
598 aa  632  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  53.26 
 
 
596 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  53.62 
 
 
596 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  52.57 
 
 
593 aa  608  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  51.79 
 
 
600 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  42.91 
 
 
572 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  43.61 
 
 
572 aa  461  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  38.33 
 
 
587 aa  277  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  35.89 
 
 
579 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  38.13 
 
 
565 aa  262  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1494  putative inner membrane transmembrane protein  37.98 
 
 
565 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2198  hypothetical protein  36.03 
 
 
589 aa  242  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0401619  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2319  putative inner membrane transmembrane protein  36.5 
 
 
575 aa  242  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2808  hypothetical protein  35.54 
 
 
537 aa  228  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2901  putative inner membrane transmembrane protein  34.85 
 
 
601 aa  228  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0012  putative inner membrane transmembrane protein  35.14 
 
 
616 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672275  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  31.21 
 
 
540 aa  176  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
558 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  30.61 
 
 
674 aa  157  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  36.96 
 
 
616 aa  153  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  30.63 
 
 
552 aa  151  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  28.79 
 
 
660 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  30.77 
 
 
674 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  27.48 
 
 
569 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  29.91 
 
 
519 aa  126  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  35.86 
 
 
581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  24.66 
 
 
599 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  25.04 
 
 
636 aa  94.4  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  26.94 
 
 
645 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  26.65 
 
 
630 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  26.65 
 
 
630 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  25 
 
 
563 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  25 
 
 
605 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  25 
 
 
605 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  25 
 
 
605 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  25 
 
 
635 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  25 
 
 
635 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  25 
 
 
605 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  26.78 
 
 
645 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  26.54 
 
 
630 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  25.21 
 
 
648 aa  87.4  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  26.34 
 
 
630 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  25.39 
 
 
668 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
631 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
613 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>