84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2314 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  100 
 
 		 645 aa  1271    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  77.53 
 
 		 631 aa  899    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  60.62 
 
 		 668 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  87.6 
 
 		 630 aa  1049    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  67.24 
 
 		 636 aa  800    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  87.92 
 
 		 630 aa  1055    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  88.71 
 
 		 630 aa  1045    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  64.94 
 
 		 599 aa  671    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  98.91 
 
 		 645 aa  1256    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  68.81 
 
 		 635 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  87.6 
 
 		 630 aa  1049    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  70.95 
 
 		 605 aa  808    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  63.48 
 
 		 648 aa  707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  70.95 
 
 		 605 aa  808    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  68.81 
 
 		 635 aa  822    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  70.95 
 
 		 605 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  73.39 
 
 		 563 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  70.95 
 
 		 605 aa  808    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  35.04 
 
 		 569 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  32.19 
 
 		 674 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  32.43 
 
 		 674 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  33.03 
 
 		 660 aa  237  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 		 558 aa  194  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  27.42 
 
 		 600 aa  127  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  30.52 
 
 		 552 aa  123  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  25.54 
 
 		 585 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  27.02 
 
 		 598 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  26.69 
 
 		 596 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  26.53 
 
 		 596 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  26.53 
 
 		 582 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  26.37 
 
 		 605 aa  97.8  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  26.63 
 
 		 605 aa  97.4  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  25.9 
 
 		 593 aa  96.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  26.37 
 
 		 582 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  26.25 
 
 		 582 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  26.25 
 
 		 582 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  26.42 
 
 		 572 aa  95.5  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  26.25 
 
 		 582 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  26.25 
 
 		 582 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  26.64 
 
 		 601 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  26.48 
 
 		 572 aa  91.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  25.82 
 
 		 610 aa  91.3  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 604 aa  88.6  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  25.45 
 
 		 613 aa  87.8  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  25.45 
 
 		 610 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  25.45 
 
 		 610 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  25.45 
 
 		 585 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  24.96 
 
 		 585 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  24.26 
 
 		 585 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  34.16 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.79 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.85 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  31.71 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  30.77 
 
 		 519 aa  57  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.13 
 
 		 554 aa  56.2  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.13 
 
 		 554 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.13 
 
 		 554 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.61 
 
 		 569 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  28.66 
 
 		 579 aa  54.7  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.93 
 
 		 555 aa  54.7  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  27.4 
 
 		 581 aa  53.5  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 564 aa  52.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  27.59 
 
 		 541 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  28.32 
 
 		 563 aa  51.2  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.13 
 
 		 546 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.65 
 
 		 553 aa  48.5  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 		 554 aa  47.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.4 
 
 		 548 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3689  glycosyl transferase family 39  35.21 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  24.01 
 
 		 565 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.21 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.2 
 
 		 548 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.2 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.2 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.2 
 
 		 548 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.63 
 
 		 552 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3628  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 479 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.93 
 
 		 550 aa  45.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.71 
 
 		 550 aa  44.3  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.93 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  24.93 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  25.96 
 
 		 616 aa  43.9  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  24.93 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.93 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>