61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3678 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  79.61 
 
 		 660 aa  1066    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  96.44 
 
 		 674 aa  1226    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  100 
 
 		 674 aa  1321    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  31.94 
 
 		 648 aa  262  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  32.48 
 
 		 668 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  33.02 
 
 		 605 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  33.02 
 
 		 605 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  32.34 
 
 		 636 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  33.02 
 
 		 635 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  33.02 
 
 		 635 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  33.02 
 
 		 563 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  33.02 
 
 		 605 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  33.02 
 
 		 605 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  32.11 
 
 		 599 aa  237  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  31.13 
 
 		 630 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 631 aa  226  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  32.19 
 
 		 645 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  31.85 
 
 		 630 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  32.04 
 
 		 645 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  31.6 
 
 		 569 aa  207  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  32.3 
 
 		 630 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  32.3 
 
 		 630 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 558 aa  164  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  29.91 
 
 		 605 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  29.86 
 
 		 582 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  29.86 
 
 		 582 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  30.14 
 
 		 582 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  30.14 
 
 		 582 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  30.14 
 
 		 582 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  30.14 
 
 		 582 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  26.53 
 
 		 598 aa  146  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 604 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  28.59 
 
 		 610 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  28.59 
 
 		 610 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  28.32 
 
 		 610 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  29.56 
 
 		 605 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  27.6 
 
 		 596 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  27.78 
 
 		 600 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  28.68 
 
 		 585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  28.21 
 
 		 585 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  28.21 
 
 		 585 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  26.68 
 
 		 596 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  27.61 
 
 		 585 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  26.64 
 
 		 593 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  26.74 
 
 		 572 aa  127  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  26.44 
 
 		 613 aa  124  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  26.91 
 
 		 601 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  25.84 
 
 		 572 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  33.64 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  33.64 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  29.44 
 
 		 587 aa  66.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  29.25 
 
 		 519 aa  62  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.2 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  24.55 
 
 		 616 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2850  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 		 508 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  26.72 
 
 		 581 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2808  hypothetical protein  27.43 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  23.4 
 
 		 541 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  36.07 
 
 		 537 aa  44.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5588  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  36.54 
 
 		 576 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.27 
 
 		 554 aa  43.9  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>