62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1834 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  98.03 
 
 		 610 aa  1203    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  100 
 
 		 610 aa  1219    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  75.37 
 
 		 613 aa  896    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  94.87 
 
 		 585 aa  1098    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  100 
 
 		 610 aa  1219    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  87.61 
 
 		 582 aa  1019    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  85.48 
 
 		 605 aa  1026    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  87.61 
 
 		 582 aa  1019    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  88.3 
 
 		 582 aa  1023    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  88.12 
 
 		 582 aa  1021    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  86.47 
 
 		 605 aa  1037    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  87.61 
 
 		 582 aa  1019    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  92.36 
 
 		 604 aa  1096    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  99.83 
 
 		 585 aa  1165    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  95.21 
 
 		 585 aa  1101    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  76.03 
 
 		 585 aa  900    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  87.61 
 
 		 582 aa  1019    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  76.75 
 
 		 601 aa  892    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  52.48 
 
 		 598 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  53.16 
 
 		 596 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  53.51 
 
 		 596 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  51.79 
 
 		 600 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  53.08 
 
 		 593 aa  611  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  43.08 
 
 		 572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  43.43 
 
 		 572 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  38.77 
 
 		 587 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  36.59 
 
 		 579 aa  278  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2319  putative inner membrane transmembrane protein  36.79 
 
 		 575 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2901  putative inner membrane transmembrane protein  34.96 
 
 		 601 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2808  hypothetical protein  36.25 
 
 		 537 aa  240  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0012  putative inner membrane transmembrane protein  34 
 
 		 616 aa  213  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  30.32 
 
 		 540 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 558 aa  167  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  30.54 
 
 		 552 aa  160  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  36.88 
 
 		 565 aa  159  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1494  putative inner membrane transmembrane protein  36.52 
 
 		 565 aa  157  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  27.53 
 
 		 569 aa  153  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  29.04 
 
 		 674 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  28.01 
 
 		 660 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  43.01 
 
 		 616 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2198  hypothetical protein  42.13 
 
 		 589 aa  140  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0401619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  28.53 
 
 		 674 aa  134  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  29.85 
 
 		 519 aa  123  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  36.9 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  23.63 
 
 		 599 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  26.18 
 
 		 636 aa  94.7  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  26.94 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  26.94 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  26.94 
 
 		 635 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  26.94 
 
 		 605 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  26.94 
 
 		 605 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  26.94 
 
 		 635 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  25.53 
 
 		 645 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  26.94 
 
 		 563 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  25.37 
 
 		 645 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  23.41 
 
 		 648 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  22.64 
 
 		 668 aa  77  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  27.75 
 
 		 630 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  27.75 
 
 		 630 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  27.86 
 
 		 630 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  28.61 
 
 		 630 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 613 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>