54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2901 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2901  putative inner membrane transmembrane protein  100 
 
 		 601 aa  1174    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  63.22 
 
 		 616 aa  588  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2198  hypothetical protein  61.58 
 
 		 589 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0401619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2319  putative inner membrane transmembrane protein  56.03 
 
 		 575 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  57.52 
 
 		 565 aa  535  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1494  putative inner membrane transmembrane protein  57.52 
 
 		 565 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  55.85 
 
 		 579 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0012  putative inner membrane transmembrane protein  59.4 
 
 		 616 aa  514  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  56.08 
 
 		 581 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  49.82 
 
 		 587 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2808  hypothetical protein  49.73 
 
 		 537 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  34.58 
 
 		 610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  34.58 
 
 		 610 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  34.58 
 
 		 610 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  35.55 
 
 		 585 aa  299  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  35.02 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  33.95 
 
 		 600 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  32.75 
 
 		 572 aa  293  8e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  34.13 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  34.68 
 
 		 585 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  34.5 
 
 		 585 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  34.65 
 
 		 582 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  35.07 
 
 		 605 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  34.82 
 
 		 582 aa  290  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  34.82 
 
 		 582 aa  290  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  34.82 
 
 		 582 aa  290  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  34.82 
 
 		 582 aa  290  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  32.53 
 
 		 572 aa  290  7e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  34.59 
 
 		 605 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  34.65 
 
 		 582 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  34.79 
 
 		 601 aa  289  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 604 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  34.08 
 
 		 596 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  33.33 
 
 		 596 aa  287  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  34.65 
 
 		 593 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  35.32 
 
 		 613 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  28.01 
 
 		 540 aa  94  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  27.73 
 
 		 519 aa  85.5  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  27.64 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  25.37 
 
 		 674 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  26.09 
 
 		 660 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  26.87 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  26.87 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  27.24 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  27.14 
 
 		 645 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  26.22 
 
 		 630 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  28.1 
 
 		 648 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  25.94 
 
 		 599 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  26.38 
 
 		 674 aa  53.9  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  25.94 
 
 		 630 aa  51.6  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  28.23 
 
 		 668 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 631 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  26.84 
 
 		 569 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>