54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1494 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1494  putative inner membrane transmembrane protein  100 
 
 		 565 aa  1087    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  99.29 
 
 		 565 aa  1079    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  61.47 
 
 		 579 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  65.45 
 
 		 581 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0012  putative inner membrane transmembrane protein  63.23 
 
 		 616 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2901  putative inner membrane transmembrane protein  57.52 
 
 		 601 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2198  hypothetical protein  56.9 
 
 		 589 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0401619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  55.56 
 
 		 616 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2319  putative inner membrane transmembrane protein  50.09 
 
 		 575 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  49.55 
 
 		 587 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2808  hypothetical protein  49.36 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  38.79 
 
 		 585 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  38.97 
 
 		 585 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  38.01 
 
 		 604 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  38.46 
 
 		 610 aa  301  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  36.28 
 
 		 585 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  38.12 
 
 		 610 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  38.12 
 
 		 610 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  37.86 
 
 		 605 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  38.12 
 
 		 585 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  35.44 
 
 		 598 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  37.98 
 
 		 582 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  37.98 
 
 		 582 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  37.98 
 
 		 582 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  37.98 
 
 		 582 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  37.98 
 
 		 582 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  37.33 
 
 		 605 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  37.98 
 
 		 582 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  34.91 
 
 		 596 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  36.41 
 
 		 613 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  35.49 
 
 		 600 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  34.04 
 
 		 596 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  36.44 
 
 		 601 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  35.08 
 
 		 593 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  32.34 
 
 		 572 aa  259  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  31.46 
 
 		 572 aa  244  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  27.91 
 
 		 540 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 		 558 aa  103  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  29.2 
 
 		 552 aa  87.4  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  24.91 
 
 		 519 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  29.28 
 
 		 660 aa  57  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  23.35 
 
 		 630 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  27.15 
 
 		 563 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  27.15 
 
 		 605 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  27.15 
 
 		 605 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  24.83 
 
 		 636 aa  48.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  27.56 
 
 		 569 aa  47.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  27.6 
 
 		 635 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  27.6 
 
 		 635 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  27.27 
 
 		 605 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  27.27 
 
 		 605 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  24.89 
 
 		 668 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 631 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  24.62 
 
 		 599 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>