91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3242 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  61.33 
 
 		 630 aa  726    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  60.86 
 
 		 630 aa  722    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  100 
 
 		 668 aa  1326    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  65.87 
 
 		 605 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  65.96 
 
 		 636 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  66.02 
 
 		 630 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  60.62 
 
 		 645 aa  722    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  60.77 
 
 		 645 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  60.86 
 
 		 630 aa  722    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  62.74 
 
 		 635 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  65.32 
 
 		 631 aa  697    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  69.52 
 
 		 648 aa  822    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  62.74 
 
 		 635 aa  749    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  65.87 
 
 		 605 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  65.87 
 
 		 605 aa  744    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  65.87 
 
 		 605 aa  744    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  66.73 
 
 		 563 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  60 
 
 		 599 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  34.31 
 
 		 660 aa  282  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  33.23 
 
 		 674 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  32.75 
 
 		 674 aa  267  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  36.28 
 
 		 569 aa  247  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  31.83 
 
 		 558 aa  223  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  26.24 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  25.96 
 
 		 596 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  29.98 
 
 		 552 aa  120  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  25.5 
 
 		 596 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  24.71 
 
 		 600 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  26.19 
 
 		 572 aa  106  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  24.83 
 
 		 593 aa  97.4  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  24.75 
 
 		 585 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  25.39 
 
 		 582 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  25.21 
 
 		 605 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  25.39 
 
 		 582 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  25.21 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  25.21 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  25.21 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  25.21 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  25.9 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  24.62 
 
 		 572 aa  85.1  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  24.08 
 
 		 601 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  22.97 
 
 		 610 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  22.97 
 
 		 610 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 604 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  22.97 
 
 		 585 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  23.58 
 
 		 613 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  22.45 
 
 		 610 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  35.15 
 
 		 540 aa  73.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  22.56 
 
 		 585 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  22.02 
 
 		 585 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  28.28 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.72 
 
 		 569 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  32.35 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  28.88 
 
 		 587 aa  60.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  28.4 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  26.07 
 
 		 616 aa  56.2  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.49 
 
 		 554 aa  55.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.49 
 
 		 554 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.49 
 
 		 554 aa  55.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.35 
 
 		 555 aa  54.3  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 493 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  34.48 
 
 		 540 aa  52.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.72 
 
 		 549 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  30.53 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  29 
 
 		 537 aa  48.5  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1494  putative inner membrane transmembrane protein  24.78 
 
 		 565 aa  47.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.52 
 
 		 550 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 534 aa  47.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  23.72 
 
 		 550 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  23.72 
 
 		 550 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.72 
 
 		 550 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.72 
 
 		 550 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5109  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 509 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3689  glycosyl transferase family 39  24.36 
 
 		 524 aa  46.2  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.72 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5588  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.46 
 
 		 576 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1534  putative glycosyltransferase  30.23 
 
 		 532 aa  46.6  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.72 
 
 		 550 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 585 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.72 
 
 		 550 aa  46.6  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  24.44 
 
 		 565 aa  46.6  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  28.71 
 
 		 580 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 553 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.42 
 
 		 549 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.36 
 
 		 550 aa  45.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2420  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.56 
 
 		 695 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0370858  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  25.46 
 
 		 541 aa  44.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2198  hypothetical protein  26.67 
 
 		 589 aa  44.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0401619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18330  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.87 
 
 		 549 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0521799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  22.35 
 
 		 574 aa  43.9  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 477 aa  43.9  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>