More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1463 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1463  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
431 aa  814    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  69.25 
 
 
438 aa  500  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  32.99 
 
 
426 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
412 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  29.46 
 
 
412 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
453 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.56 
 
 
447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 
440 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  30.13 
 
 
418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
418 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  31.34 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  32.05 
 
 
446 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.49 
 
 
418 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.4 
 
 
413 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
409 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  33.98 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  33.24 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  31.22 
 
 
441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  32.56 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  29.9 
 
 
424 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
408 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
423 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  26.91 
 
 
410 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  25.47 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.27 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.51 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
440 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.82 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
432 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  28.22 
 
 
428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
435 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
413 aa  111  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  27.51 
 
 
407 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  31.97 
 
 
405 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  30.18 
 
 
418 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  30.17 
 
 
414 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
433 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 
461 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.61 
 
 
429 aa  106  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  29.32 
 
 
429 aa  106  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
453 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
419 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  28.44 
 
 
423 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.74 
 
 
431 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.31 
 
 
450 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  28.36 
 
 
413 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  27.73 
 
 
426 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
414 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  29.96 
 
 
526 aa  103  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
424 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  30.15 
 
 
553 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  29.38 
 
 
416 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 
436 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
404 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
419 aa  100  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
450 aa  99.8  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
446 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  30.48 
 
 
429 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  28.42 
 
 
412 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.48 
 
 
446 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  30.43 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
417 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 
428 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  29.46 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
494 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  30.39 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  27.17 
 
 
424 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
431 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2772  major facilitator transporter  29.41 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
402 aa  97.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3270  major facilitator transporter  29.55 
 
 
435 aa  96.7  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  30.05 
 
 
413 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  30.05 
 
 
413 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  28.91 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  29.46 
 
 
419 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  30.51 
 
 
414 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  25.31 
 
 
415 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
418 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  29.62 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  27.95 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 
417 aa  93.2  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  30.19 
 
 
441 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  30.28 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  31.06 
 
 
457 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  26.36 
 
 
408 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2250  major facilitator transporter  22.03 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2211  major facilitator transporter  22.03 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  29.23 
 
 
419 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  30.9 
 
 
414 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
456 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  28.61 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  28.61 
 
 
450 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>