More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3366 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3366  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3332  major facilitator superfamily permease  98.53 
 
 		 204 aa  390  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1161  hypothetical protein  98.53 
 
 		 204 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.372975  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2383  hypothetical protein  98.53 
 
 		 204 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2569  hypothetical protein  98.04 
 
 		 207 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0299  hypothetical protein  98.04 
 
 		 207 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  89.05 
 
 		 427 aa  340  9e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  93.53 
 
 		 499 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  78.39 
 
 		 425 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  78.39 
 
 		 425 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  78.39 
 
 		 425 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  79.59 
 
 		 425 aa  304  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  79.59 
 
 		 425 aa  303  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  78.57 
 
 		 425 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  76.88 
 
 		 425 aa  286  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  70.92 
 
 		 425 aa  265  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  70.41 
 
 		 425 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  67.35 
 
 		 425 aa  262  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 427 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  47.54 
 
 		 428 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 428 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 428 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 428 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 440 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  48.31 
 
 		 452 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 428 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  48.31 
 
 		 425 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  47.75 
 
 		 435 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  47.75 
 
 		 413 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  47.75 
 
 		 413 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 428 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 428 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  47.31 
 
 		 438 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 		 438 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  43.48 
 
 		 429 aa  158  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  41.76 
 
 		 431 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  46.55 
 
 		 430 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  46.55 
 
 		 430 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  46.55 
 
 		 430 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  46.55 
 
 		 430 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  46.55 
 
 		 430 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  46.55 
 
 		 430 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  46.55 
 
 		 417 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 		 443 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  44.85 
 
 		 430 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  46.01 
 
 		 435 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  46.01 
 
 		 435 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  44.79 
 
 		 435 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 442 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  44.79 
 
 		 435 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  45.4 
 
 		 435 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  45.4 
 
 		 435 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 		 443 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  45.05 
 
 		 430 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  42.02 
 
 		 435 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.33 
 
 		 454 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.98 
 
 		 430 aa  141  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 461 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 		 425 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  43.41 
 
 		 457 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  44.2 
 
 		 424 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 438 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  41.24 
 
 		 440 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 438 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 438 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  46.2 
 
 		 438 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 438 aa  135  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.55 
 
 		 435 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  45 
 
 		 447 aa  134  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 		 444 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  42.65 
 
 		 441 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2104  major facilitator family transporter  40.4 
 
 		 432 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  40.41 
 
 		 436 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 440 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 436 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  46.2 
 
 		 438 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  44.32 
 
 		 431 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1899  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 430 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00967745  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 436 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  41.4 
 
 		 433 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  40.22 
 
 		 433 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  46.36 
 
 		 431 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6303  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.45 
 
 		 438 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3167  citrate-proton symport  40.56 
 
 		 433 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.905782  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  39.11 
 
 		 439 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 435 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  39.47 
 
 		 440 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  38.27 
 
 		 436 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  39.47 
 
 		 440 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  39.66 
 
 		 439 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.22 
 
 		 433 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 440 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02399  citrate carrier protein  38.07 
 
 		 425 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  40.57 
 
 		 429 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.67 
 
 		 437 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  38.95 
 
 		 444 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  36 
 
 		 437 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6136  general substrate transporter  38.64 
 
 		 477 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2761  General substrate transporter  39.13 
 
 		 437 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 447 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>