More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1318 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1318  LacI family response repressor  100 
 
 		 336 aa  681    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.119217  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1292  transcriptional regulator, LacI family  54.1 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1506  LacI family response repressor  46.13 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1304  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  45.21 
 
 		 337 aa  295  9e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1322  LacI family response repressor  46.5 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.465092  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1488  LacI family response repressor  39.21 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  37.94 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  34.9 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0417  LacI family transcription regulator  35.1 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0627  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.958953 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2799  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2545  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.55 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4014  Alanine racemase  32.24 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.251479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3955  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337972  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1489  LacI family response repressor  36.33 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  29.74 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.94 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2164  LacI family transcription regulator  32.39 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  28.74 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22460  transcriptional regulator  34.59 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.912929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  28.11 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  32.65 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  32.06 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.33 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3013  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  32.27 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  27.98 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 338 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  27.41 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  28.41 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  27.54 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  29.62 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  28.65 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.4 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.38 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0742  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.13843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  29.07 
 
 		 351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.28 
 
 		 348 aa  119  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  28.74 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4566  transcriptional regulator, LacI family  30.23 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.38 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.53 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  29.43 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6359  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  29.08 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.53 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.53 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  28.96 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  27.6 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 353 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  28.74 
 
 		 346 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  28.74 
 
 		 346 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  31.79 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  30.47 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.51 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  27.79 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0116  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.32 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  26.89 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4618  regulatory protein LacI  30.92 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2472  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  27.94 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  32.37 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  29.71 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  29.02 
 
 		 352 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  31.81 
 
 		 362 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1459  LacI family transcription regulator  30.92 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  26.63 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.63 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  27.19 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.05 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3698  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.2 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.2 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.99 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.2 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  30.86 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.2 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  29.36 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.2 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  28.73 
 
 		 368 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1332  transcriptional regulator, LacI family  31.16 
 
 		 377 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3256  LacI family transcription regulator  29.53 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5117  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  26.39 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  29.63 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  30.88 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  28.36 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  27.25 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6854  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000835434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  26.9 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  27.27 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  29.08 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>