More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1506 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1506  LacI family response repressor  100 
 
 		 338 aa  686    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1304  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  62.69 
 
 		 337 aa  431  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1318  LacI family response repressor  46.13 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.119217  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1292  transcriptional regulator, LacI family  46.08 
 
 		 341 aa  293  2e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1322  LacI family response repressor  44.86 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.465092  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1488  LacI family response repressor  36.63 
 
 		 339 aa  192  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  35.36 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2799  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0627  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.958953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0417  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2545  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.64 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4014  Alanine racemase  33.33 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.251479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  31.66 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3955  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337972  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  29.59 
 
 		 336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  30.23 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  30.61 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1489  LacI family response repressor  29.76 
 
 		 256 aa  139  8.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22460  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.912929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  29.34 
 
 		 351 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  30.66 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0742  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.13843  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  32.46 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  31.88 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01740  transcriptional regulator  31.23 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.45 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  30.27 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  30.88 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  29.11 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  29.21 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2164  LacI family transcription regulator  30.57 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  29.34 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  29.02 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  27.94 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.5 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  25.29 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  29.11 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5149  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 346 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 		 349 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  29.91 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  27.75 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  30.03 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2467  LacI family transcription regulator  30.91 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000453597  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  28.7 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.96 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.91 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.88 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  29.17 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  27.73 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  26.82 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  27.43 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0927  LacI family transcription regulator  28.87 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.845689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.61 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 368 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0116  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.79 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  29.24 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  27.81 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  30.33 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  31.41 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.4 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  29.33 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.4 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  26.35 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1929  LacI family transcription regulator  30.24 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  26.76 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2999  transcriptional regulator, LacI family  24.42 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  27.73 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.29 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  26.98 
 
 		 340 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  29.2 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.82 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  29.77 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  29.33 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  29.33 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  28.9 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  29.33 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.47 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4341  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  29.55 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  27.43 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0436  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  29.13 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3611  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.62 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1332  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.77 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>