More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_22460 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_22460  transcriptional regulator  100 
 
 
339 aa  666    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.912929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0742  LacI family transcription regulator  45.77 
 
 
342 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.13843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  45.89 
 
 
351 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0417  LacI family transcription regulator  39.41 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0627  transcriptional regulator, LacI family  38.95 
 
 
350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  41.95 
 
 
348 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5149  transcriptional regulator, LacI family  38.71 
 
 
346 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 
363 aa  205  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2799  transcriptional regulator, LacI family  39.17 
 
 
340 aa  192  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2545  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.19 
 
 
341 aa  179  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01740  transcriptional regulator  40.35 
 
 
355 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.42091  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2164  LacI family transcription regulator  41.12 
 
 
347 aa  169  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.17 
 
 
353 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  34.99 
 
 
337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  32.46 
 
 
335 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.75 
 
 
335 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  34.99 
 
 
337 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 
337 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  38.81 
 
 
335 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  35.47 
 
 
349 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.76 
 
 
353 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  35.94 
 
 
337 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.43 
 
 
335 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.26 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 
330 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  31.53 
 
 
333 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  31.47 
 
 
333 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.76 
 
 
337 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  37.27 
 
 
362 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.04 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3955  transcriptional regulator, LacI family  36.05 
 
 
364 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337972  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0306  LacI family transcription regulator  35.03 
 
 
342 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.46 
 
 
342 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  36.04 
 
 
343 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  36.18 
 
 
332 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  36.04 
 
 
343 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  36.04 
 
 
343 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1304  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  29.88 
 
 
337 aa  150  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  31.76 
 
 
341 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  31.76 
 
 
341 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.76 
 
 
341 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.76 
 
 
341 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.76 
 
 
341 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  31.76 
 
 
341 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.76 
 
 
341 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.76 
 
 
341 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.44 
 
 
341 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.44 
 
 
341 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.44 
 
 
341 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.47 
 
 
341 aa  149  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.44 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.44 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  27.98 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  35.06 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1050  transcriptional regulator, LacI family  35.57 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107431  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1488  LacI family response repressor  35.94 
 
 
339 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4014  Alanine racemase  34.81 
 
 
330 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.251479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.69 
 
 
343 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  35.37 
 
 
355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.38 
 
 
347 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.67 
 
 
336 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.69 
 
 
343 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.69 
 
 
343 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.72 
 
 
342 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.72 
 
 
342 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.69 
 
 
343 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  36.75 
 
 
346 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.43 
 
 
341 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.1 
 
 
341 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.14 
 
 
341 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.04 
 
 
341 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 
339 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.59 
 
 
341 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.04 
 
 
341 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.04 
 
 
341 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.28 
 
 
333 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.03 
 
 
332 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 
335 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.4 
 
 
346 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  37.1 
 
 
342 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 
346 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.08 
 
 
339 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 
338 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.36 
 
 
330 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  35.19 
 
 
352 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  30.09 
 
 
334 aa  142  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  32.64 
 
 
336 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.6 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  35 
 
 
367 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  32.92 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.97 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  34.88 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  35 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  34.71 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>